结论：事业单位将加班补助打给劳务公司是否合规，需根据具体情况判断，包括劳务派遣协议的约定、加班补助的性质以及相关法律法规的规定。以下从多个角度进行分析：

一、劳务派遣协议的约定

1. 协议内容：首先，需要查看事业单位与劳务公司之间签订的劳务派遣协议中，是否有关于加班补助支付方式的明确约定。如果协议中明确规定了加班补助应由事业单位直接支付给劳务派遣员工，那么事业单位将加班补助打给劳务公司可能就不合规。
2. 协议变更：如果协议中没有明确规定，或者双方后续有变更协议的约定，那么事业单位将加班补助打给劳务公司可能是基于双方的协商一致，这种情况下可能是合规的。

二、加班补助的性质

1. 工资组成部分：根据《劳动法》和相关规定，加班补助通常被视为工资的一部分。如果加班补助是劳务派遣员工应得的工资性收入，那么事业单位应直接支付给员工，而不是通过劳务公司中转。
2. 特殊补贴：如果加班补助是事业单位对劳务派遣员工的一种特殊补贴或奖励，且双方协议中有明确约定可以通过劳务公司支付，那么这种情况下可能是合规的。

三、相关法律法规的规定

1. 劳务派遣规定：根据《劳动合同法》等法律法规，劳务派遣单位应当履行对劳动者的义务，包括支付劳动报酬等。如果事业单位将加班补助打给劳务公司，而劳务公司未能及时、足额地将加班补助支付给劳务派遣员工，那么事业单位和劳务公司都可能面临法律责任。
2. 工资支付规定：根据《工资支付暂行规定》等，工资应当在用人单位与劳动者约定的日期支付，且应直接支付给劳动者本人。如果事业单位将加班补助打给劳务公司，而劳务公司并非劳动者的直接用人单位，这种支付方式可能不符合工资支付的规定。

四、合规建议

1. 明确协议内容：事业单位与劳务公司应明确劳务派遣协议中关于加班补助的支付方式，确保符合法律法规的规定和双方的约定。
2. 直接支付给员工：如果可能的话，事业单位应直接将加班补助支付给劳务派遣员工，以避免可能的法律风险和纠纷。
3. 监督劳务公司支付：如果事业单位确实需要通过劳务公司支付加班补助，那么应加强对劳务公司的监督，确保其及时、足额地将加班补助支付给劳务派遣员工。

后续行动建议：如果您是事业单位或劳务公司的相关人员，且对加班补助的支付方式存在疑问或担忧，建议您直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和指导。