可以单独另案起诉要求对基金、股票进行查明和分割。具体分析如下：

1. 诉讼程序独立性原则
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，每个案件的审理范围以当事人诉讼请求为限。若一审、二审均未对基金、股票等财产进行审理，属于遗漏诉讼请求的情形。此时，当事人有权以“新的事实和理由”另行起诉，要求分割该部分财产，法院应当受理。

2. 财产分割的时效性
   若基金、股票属于夫妻共同财产或共同投资收益，且在离婚诉讼中未被处理，则不受离婚诉讼时效限制。当事人可在发现该财产后随时起诉分割，但需注意诉讼时效一般自知道或应当知道权利受损之日起3年（特殊情形除外）。

3. 另案起诉的实务操作

   • 证据准备：需提供基金、股票的账户信息、交易记录、资金来源等证据，证明其属于共同财产或需分割的范围。
     
   • 诉讼请求明确：需在诉状中清晰列明要求分割的具体财产（如基金份额、股票数量及市值）及分割方式（如按比例分配或折价补偿）。
     
   • 法院管辖：一般由被告住所地或财产所在地法院管辖，需根据具体情况选择。

4. 风险提示

   • 若基金、股票已在一审、二审中被提及但法院未处理，需确认是否因当事人未主张或证据不足导致。若是后者，另案起诉时需补充证据。
     
   • 若财产涉及第三方（如信托计划、公司股权），可能需追加第三人或通过其他法律程序解决，增加诉讼复杂度。

建议：若您持有相关财产证据且一审、二审未处理，可尽快另行起诉。具体操作可进一步向我提供财产类型、账户信息等细节，以便制定更精准的诉讼策略。