在建设工程合同被认定无效的情况下，司法鉴定依然可以开展，但需遵循特定的规则与流程，以下是详细说明：

1. 鉴定事项的确定

   • 工程质量鉴定：即便合同无效，工程质量仍是核心关注点。若双方对工程质量存在争议，可申请对工程是否符合国家强制性标准、行业规范以及设计文件要求等进行鉴定。例如，在某案例中，合同因违反招投标程序被认定无效，但工程存在严重质量问题，通过司法鉴定确定了质量缺陷的具体部位和程度，为后续责任认定提供了依据。
   • 工程造价鉴定：对于已完成部分的工程造价，可申请鉴定以确定实际发生的成本。这有助于在合同无效后，按照实际投入和公平原则确定应支付的款项。比如，在一些工程中，合同约定的计价方式不合理，通过造价鉴定可以更准确地反映工程的实际价值。
   • 工期鉴定：若工期延误引发纠纷，可对实际工期、合理工期以及工期延误的原因进行鉴定。这有助于明确各方在工期方面的责任，例如，因发包人原因导致的工期延误，通过鉴定可以确定延误的具体天数和影响范围。

2. 鉴定申请的主体与时间

   • 申请主体：一般由当事人提出鉴定申请，但在某些情况下，法院也可以依职权委托鉴定。例如，当案件涉及公共利益或重大社会影响时，法院可能会主动启动鉴定程序。
   • 申请时间：通常在举证期限内提出鉴定申请，但若在庭审过程中发现需要鉴定的事项，也可及时向法院申请。例如，在庭审中，一方当事人提出新的证据表明工程质量存在问题，此时可申请进行质量鉴定。

3. 鉴定机构的选择

   • 协商选择：当事人可以协商确定鉴定机构，这有助于提高鉴定的效率和公正性。双方可以根据鉴定机构的专业资质、信誉、经验等因素进行选择。
   • 法院指定：若当事人无法协商一致，由法院指定鉴定机构。法院会从符合条件的鉴定机构名录中随机选择，确保鉴定的公正性和客观性。

4. 鉴定依据与标准

   • 依据合同约定：尽管合同无效，但合同中关于技术标准、质量要求等条款，若不违反法律、行政法规的强制性规定，仍可作为鉴定的参考依据。例如，合同中约定的建筑材料质量标准，可作为质量鉴定的参考。
   • 依据国家规范与行业标准：在合同约定不明确或无效的情况下，应依据国家强制性标准、行业规范以及地方标准进行鉴定。这些标准是工程建设的基本要求，具有权威性和普遍适用性。

5. 鉴定意见的审查与采信

   • 审查内容：法院会对鉴定意见进行全面审查，包括鉴定机构的资质、鉴定人员的资格、鉴定程序的合法性、鉴定依据的充分性等。例如，若鉴定机构超出其资质范围进行鉴定，或鉴定人员不具备相应资格，鉴定意见可能不被采信。
   • 采信规则：若鉴定意见经审查合法、真实、有效，法院会将其作为认定案件事实的重要依据。但若一方当事人对鉴定意见有异议，可申请重新鉴定或补充鉴定，但需符合法定条件。

在建设工程合同无效的情况下进行司法鉴定，需严格按照法定程序和规则进行，以确保鉴定结果的公正性和权威性。如果你有具体的案件或疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议。