结论前置：按工时计算工资是合法的，但用人单位在实施时需严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到充分保障。以下是对这一问题的详细分析：
合法性基础
劳动法律法规支持：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资的计算方式多样，其中按工时计算（即计时工资）是被明确认可的一种合法形式。它依据劳动者实际工作时间来确定报酬，体现了劳动的直接价值。
工时制度遵循：
- 用人单位在采用计时工资制时，必须遵守法定的工时制度，如标准工时制（每日不超过8小时，每周不超过40小时）或经审批的特殊工时制度。只有在此框架下合理安排工作时间并准确计算工资，才能确保合法性。
劳动者权益保障
加班工资规定：
- 若安排劳动者在正常工作时间外加班，用人单位需按照法律规定支付加班工资。具体标准为：延长工作时间的，支付不低于工资的150%；休息日工作且不能补休的，支付不低于工资的200%；法定休假日工作的，支付不低于工资的300%。
最低工资标准：
- 无论采用何种工资计算方式，用人单位支付的工资均不得低于当地最低工资标准。这是《劳动法》明确规定的最低工资保障制度，旨在保护劳动者的基本生活权益。例如，如果当地最低工资标准为每小时XX元，那么按工时计算的工资每小时也不得低于这个标准。
工资支付规范：
- 根据《工资支付暂行规定》，工资必须在约定的日期支付，且至少每月支付一次。对于实行周、日、小时工资制的，可按相应周期支付，但需确保及时、足额。
特殊情况说明
- 非全日制用工：
- 在非全日制用工形式下，劳动报酬通常按小时计酬，结算和支付周期较短。虽然双方可口头约定，无需书面劳动合同，但小时计酬标准仍不得低于当地最低小时工资标准。
实际操作建议
明确约定：
- 用人单位与劳动者在签订劳动合同时，应当明确约定工资支付方式（如按工时计算）、支付时间以及加班工资的计算方法等关键条款，以避免后续产生纠纷。
准确记录工时：
- 用人单位应准确记录劳动者的工作时间，包括正常工作时间和加班时间，以便准确计算工资和加班工资。
及时支付工资：
- 用人单位应按照约定的时间及时支付工资，确保劳动者的合法权益得到保障。
法律后果
如果用人单位违反相关法律法规，如未按时支付工资、未支付加班工资或支付的工资低于最低工资标准等，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位补发工资、支付加班工资及经济补偿等。
总结：按工时计算工资是合法的，但用人单位在实施时需严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。