结论前置：职工的加班费基数仅以基本工资为基数计算，通常是不合法的。加班费计算基数应综合考虑多个因素，包括劳动合同约定、实际工资情况等。
加班费计算基数的法律规定
劳动合同约定优先：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，如果劳动合同中明确约定了工资数额，且该约定不低于当地最低工资标准，应以劳动合同约定的工资作为加班费计算基准。这里的工资应理解为包含基本工资、岗位工资、职务工资等在内的总和，而非单独的基本工资。
实际工资情况次之：
- 当劳动合同没有明确约定工资数额或约定不明确时，应以实际工资作为计算基数。实际工资包括用人单位直接支付给劳动者的所有报酬，如工资、奖金、津贴、补贴等（需扣除加班费、伙食补助和劳动保护补贴等）。
最低工资标准兜底：
- 若劳动者工资低于当地最低工资标准，则应以最低工资标准作为加班费的计算基数，以保障劳动者的基本权益。
加班费支付标准的法律规定
- 延长工作时间：用人单位安排劳动者在日法定标准工作时间以外延长工作时间的，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付加班费。
- 休息日工作：用人单位安排劳动者在休息日工作且不能安排补休的，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付加班费。
- 法定休假日工作：用人单位安排劳动者在法定休假节日工作的，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班费。
实际操作中的合理性与不合理性
合理方面：
- 对于工资结构简单、主要以基本工资为主的岗位，如果劳动合同中有明确约定以基本工资为加班费计算基数，且该约定不低于当地最低工资标准，那么这种做法在法律上是允许的。然而，这种情况在实际操作中较为罕见，因为大多数劳动者的工资构成都包含除基本工资外的其他收入部分。
不合理方面：
- 对于工资结构复杂、包含多种津贴、补贴、绩效工资等项目的员工来说，仅按基本工资计算加班费会显著减少其应得的加班费，损害其经济利益。这种情况下，应按实际工资总额作为计算基数。如果用人单位未经协商一致单方面决定按基本工资计算加班费，这些做法可能损害劳动者的合法权益，被视为不合理且可能违法。
加班费计算公式（以月工资为例）
工作日加班费：
- 公式：\(月工资（含基本工资、绩效工资、津贴等）\div21.75\div8\times加班小时数\times1.5\)
- 示例：假设月工资为5000元（含基本工资3000元、绩效工资2000元），工作日加班4小时，则加班费为：\(5000\div21.75\div8\times4\times1.5\approx172.41\)元。
双休日加班费：
- 公式：\(月工资（同上）\div21.75\div8\times加班小时数\times2\)
- 示例：假设月工资同上，双休日加班8小时，则加班费为：\(5000\div21.75\div8\times8\times2\approx459.77\)元。
法定节假日加班费：
- 公式：\(月工资（同上）\div21.75\div8\times加班小时数\times3\)
- 示例：假设月工资同上，法定节假日加班8小时，则加班费为：\(5000\div21.75\div8\times8\times3\approx689.66\)元。
劳动者权益保障建议
如果劳动者认为用人单位计算加班费方式不合法，应首先尝试与用人单位进行协商沟通，要求按照法律规定或合理的方式重新确定加班费计算基数。若协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
总之，加班费计算基数是一个复杂的问题，需要综合考虑多个因素来确定。在实际操作中，应严格遵循相关法律法规的规定，并结合具体情况进行综合判断。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。