医院绩效工资被扣，申请劳动仲裁是有用的，但具体效果取决于多个因素。以下是对此问题的详细分析：

一、劳动仲裁的法律依据与适用范围

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条，因劳动报酬等发生的争议属于劳动争议范畴，可依法申请劳动仲裁。绩效工资作为劳动报酬的一部分，若用人单位无故克扣或扣除依据不明确，劳动者完全有权通过劳动仲裁来维护自己的合法权益。

二、绩效工资被扣的常见情形及合法性判断

1. 合法扣除情形：

   • 绩效考核不达标且制度明确：如果医院的绩效考核制度明确，且员工确实未达到考核标准，那么医院有权根据制度扣除相应的绩效工资。
   • 严重违反公司规章制度：如员工严重违反医院的规章制度，医院也有权根据规定扣除绩效工资。
   • 造成重大经济损失：若员工因工作失误给医院造成重大经济损失，医院在扣除绩效工资时需有明确的依据和合理的计算方式。

2. 非法扣除情形：

   • 无明确考核标准或流程：如果医院没有明确的绩效考核标准或流程，或者未向员工公示，那么扣除绩效工资可能缺乏合法性。
   • 未公示考核结果：医院在扣除绩效工资前，应向员工公示考核结果，确保员工对考核结果有异议时能够及时申诉。
   • 恶意压低评分：如果医院存在恶意压低员工评分以扣除绩效工资的行为，这显然是不合法的。
   • 与工作表现无关的个人原因扣款：如因员工个人原因（如迟到、早退等）而扣除绩效工资，但这些原因与工作表现无直接关联，且未在规章制度中明确规定，那么这种扣除也是不合法的。

三、劳动仲裁的有效性条件

1. 证据充分性：劳动者在申请劳动仲裁时，需提供充分的证据来证明医院扣除绩效工资的行为是不合理的。这些证据可以包括劳动合同、工资条、绩效考核记录、与医院沟通的记录等。例如，如果员工能够提供考勤记录和任务完成证明来反驳医院“工作态度差”的扣款理由，那么其仲裁请求就更有可能得到支持。

2. 程序合规性：医院在扣除绩效工资时，必须遵循相关的程序规定。如医院未提前告知考核标准、未给予员工申诉机会等，即使存在考核制度，也可能被认定违法。例如，某企业未公示考核细则即扣款，最终被裁定补发工资。

3. 时效要求：劳动者需在知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请，逾期可能丧失胜诉权。因此，劳动者在发现医院扣除绩效工资的行为后，应及时咨询专业律师并准备相关证据，以便在法定时效内提出仲裁申请。

四、劳动仲裁的实际作用

1. 追回损失：成功申请劳动仲裁后，劳动者有可能追回被医院非法扣除的绩效工资差额及经济补偿金。根据相关案例显示，70%以上的合理诉求可获得支持。

2. 规范用工：仲裁结果可促使医院完善绩效考核制度，避免类似纠纷再次发生。这对于维护劳动者的合法权益和促进医院的和谐发展都具有积极意义。

3. 法律威慑：即便部分诉求未获支持，劳动仲裁也能引起医院对劳动法规的重视，从而规范其用工行为。这对于提高整个社会的劳动法治水平也具有积极作用。

建议：如果你发现医院无故扣除了你的绩效工资，且你认为这种扣除是不合理的，那么你可以及时收集相关证据并咨询专业律师（即我，杨仲杰律师），以便在法定时效内提出劳动仲裁申请。在申请过程中，务必确保证据的充分性和程序的合规性，以提高仲裁的成功率。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。