在单位犯罪中，主要查的是直接负责的主管人员和其他直接责任人员的犯罪记录。以下是对这一问题的详细分析：

一、单位犯罪的责任主体

单位犯罪是指公司、企业、事业单位、机关、团体为本单位谋取非法利益或者以单位名义为本单位全体成员或多数成员谋取非法利益，由单位的决策机构按照单位的决策程序决定，由直接责任人员具体实施，且刑法明文规定单位应受刑罚处罚的犯罪。在单位犯罪中，责任主体主要包括两部分：

1. 直接负责的主管人员：这通常指的是在单位犯罪中起决定、批准、授意、纵容、指挥等作用的人员，他们一般是单位的主管负责人，包括法定代表人。
2. 其他直接责任人员：这指的是在单位犯罪中具体实施犯罪行为并起较大作用的人员，他们既可以是单位的经营管理人员，也可以是单位的职工，包括聘任、雇佣的人员。

二、犯罪记录的查询

在单位犯罪案件中，司法机关会重点查询上述两类人员的犯罪记录。这是因为：

1. 直接负责的主管人员：由于他们在单位犯罪中起主导作用，其犯罪记录对于判断单位犯罪的故意、动机以及犯罪行为的严重程度具有重要意义。
2. 其他直接责任人员：他们具体实施了犯罪行为，其犯罪记录直接反映了犯罪行为的实施情况，对于定罪量刑具有关键作用。

三、相关法律规定

根据《中华人民共和国刑法》第三十条和第三十一条的规定，公司、企业、事业单位、机关、团体实施的危害社会的行为，法律规定为单位犯罪的，应当负刑事责任。单位犯罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚。本法分则和其他法律另有规定的，依照规定。

四、实际应用中的注意事项

1. 区分单位犯罪与个人犯罪：在查询犯罪记录时，需要明确是单位犯罪还是个人犯罪。单位犯罪涉及的是单位整体和直接责任人员的刑事责任，而个人犯罪则只涉及个人的刑事责任。
2. 全面收集证据：在办理单位犯罪案件时，除了查询犯罪记录外，还需要全面收集其他证据，如单位决策文件、财务记录、合同协议等，以形成完整的证据链。
3. 注意量刑情节：在量刑时，除了考虑犯罪记录外，还需要考虑其他量刑情节，如自首、立功、认罪认罚等，以确保量刑的公正性和合理性。

总结来说，在单位犯罪中，主要查询的是直接负责的主管人员和其他直接责任人员的犯罪记录。这些记录对于判断单位犯罪的故意、动机以及犯罪行为的严重程度具有重要意义。如果你在单位犯罪案件中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。