若工程伤亡事故私了后被发现瞒报，将面临行政处罚、民事赔偿风险以及可能的刑事责任，具体处理方式如下：

1. 行政处罚层面
   根据《生产安全事故报告和调查处理条例》第三十六条，事故发生单位若存在谎报或瞒报事故的行为，应急管理部门可对其处以100万元以上500万元以下的罚款，并对主要负责人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员处上一年年收入60%至100%的罚款。此外，若瞒报行为导致事故等级被低估（如实际为较大事故但按一般事故处理），处罚力度会进一步加重。例如，某建筑公司因瞒报3人死亡事故被认定为“情节特别严重”，最终被顶格处罚500万元。

2. 民事赔偿层面
   私了协议可能因“显失公平”或“违反法律强制性规定”被撤销。根据《民法典》第一百五十一条，若伤亡者家属在签署协议时因信息不对称（如不知晓真实伤情或赔偿标准）导致权益受损，可向法院申请撤销协议并要求按法定标准补足赔偿。例如，某工地工人因工伤致残，私了时仅获赔10万元，后经鉴定为五级伤残，法院最终判决企业补足差额部分（含一次性伤残补助金、医疗费等共计80余万元）。

3. 刑事责任层面
   若瞒报行为与事故责任本身存在关联，可能触犯《刑法》第一百三十四条（重大责任事故罪）或第一百三十九条之一（不报、谎报安全事故罪）。根据司法解释，若事故造成1人以上死亡或3人以上重伤，且负有报告职责的人员隐瞒不报，可处三年以下有期徒刑或拘役；情节特别严重的（如造成3人以上死亡或10人以上重伤），处三年以上七年以下有期徒刑。例如，某项目经理因瞒报2人死亡事故被以“不报安全事故罪”判处有期徒刑二年。

实务建议：

• 立即补报：发现瞒报后应第一时间向当地应急管理部门报告，如实说明事故时间、地点、伤亡情况及已采取的措施，争取从轻处理。
  
• 重新协商赔偿：若私了协议存在瑕疵，建议与家属协商补充协议或通过调解、诉讼途径解决，避免后续纠纷。
  
• 配合调查：主动提供事故相关证据（如监控录像、施工记录、安全培训记录等），证明企业已履行部分安全义务，降低行政或刑事责任风险。
  

若涉及具体案件细节（如事故等级、私了协议内容等），可进一步向我说明，我会结合证据材料提供更精准的应对方案。