结论：违反保密协议提离职是否会影响年终奖的发放，这主要取决于保密协议中的具体条款、公司的规章制度以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度进行的分析：

1. 保密协议的具体条款：

   • 如果保密协议中明确规定了员工在违反保密义务时，公司有权取消其年终奖或其他福利待遇，那么员工在违反保密协议后，公司可能会依据此条款取消年终奖。
   • 如果保密协议中没有明确提及年终奖的取消或相关处罚措施，那么公司不能仅凭员工违反保密协议就单方面取消年终奖。

2. 公司的规章制度：

   • 除了保密协议外，公司还可能有其他规章制度对年终奖的发放进行规定。如果这些规章制度中明确规定了违反保密协议将影响年终奖的发放，那么公司可能会据此执行。
   • 如果公司的规章制度中没有相关条款，或者相关条款与保密协议相冲突，那么公司需要依据更有利于员工的原则进行解释和执行。

3. 相关法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，员工享有获得劳动报酬的权利，包括年终奖等福利待遇。公司不能随意剥夺员工的这一权利。
   • 如果公司因为员工违反保密协议而取消年终奖，需要确保这一行为符合法律法规的规定，并且有充分的证据证明员工确实违反了保密协议。

法律建议：

• 对于员工：在离职前，应仔细阅读保密协议和公司的规章制度，了解自己的权利和义务。如果认为公司取消年终奖的行为不合理或违法，可以与公司进行协商，或者向劳动争议调解委员会申请调解，甚至向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
• 对于公司：在制定保密协议和规章制度时，应明确规定违反保密义务的后果和处罚措施，包括是否影响年终奖的发放。同时，在执行这些规定时，应确保有充分的证据证明员工确实违反了保密协议，并且符合法律法规的规定。

可能的法律后果：

• 如果公司因为员工违反保密协议而取消年终奖，但无法提供充分证据或违反了相关法律法规，员工有权要求公司支付年终奖，并可能因此获得额外的赔偿。
• 如果员工确实违反了保密协议，并且公司依据保密协议或规章制度取消了年终奖，员工可能需要承担相应的法律责任，包括赔偿公司因此遭受的损失。

总之，违反保密协议提离职是否会影响年终奖的发放，需要综合考虑保密协议的具体条款、公司的规章制度以及相关法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。