结论：自离的员工，公司仍然应当支付其应得的工资。工资是劳动者付出劳动后应得的报酬，只要员工为公司提供了劳动，公司就有义务按照约定和法律规定支付工资，即使员工自离也不例外。

具体分析：

1. 工资支付义务：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，无论员工是正常离职还是自离，只要他们为公司提供了劳动，公司就应当支付相应的工资。
   • 《工资支付暂行规定》第九条也明确指出，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这进一步强调了公司支付工资的义务，不受员工离职方式的影响。

2. 自离与工资支付的关系：

   • 员工自离可能违反了公司的规章制度或劳动合同约定，但这并不构成公司拒绝支付工资的合法理由。工资支付与员工的离职方式无关，只与员工是否提供了劳动有关。
   • 即使员工自离，只要他们为公司提供了实际的劳动，公司就应当按照劳动合同或法律规定的标准支付工资。工作了多少天，就应给付多少天的工资。

3. 经济损失与工资扣除：

   • 如果员工自离给公司造成了实际经济损失，如岗位空缺导致业务受影响、需紧急招聘人员产生额外费用等，公司可以依法追究其责任，要求赔偿损失。然而，这并不能成为公司拒绝支付工资的理由。
   • 在要求员工赔偿损失的同时，公司仍应支付员工应得的工资。若需从工资中扣除赔偿费用，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

4. 员工权益保护：

   • 如果公司以员工自离为由拒绝支付工资，员工可以通过多种途径来维护自己的权益。首先，可以尝试与公司进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
   • 如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己获得工资的权益。这些途径都提供了法律上的支持和保障，确保劳动者的合法权益得到维护。

法律建议：

• 对于公司而言，应当严格遵守劳动法律法规，按时足额支付员工工资，即使员工自离也不例外。如果员工自离给公司造成损失，公司应当通过合法途径追究其责任，而不是拒绝支付工资。
• 对于员工而言，如果公司以自离为由拒绝支付工资，应当积极采取措施维护自己的权益。可以先尝试与公司协商，如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

可能法律后果：

• 如果公司拒绝支付自离员工的工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令限期支付工资、加付赔偿金等。
• 员工也可以通过法律途径追究公司的责任，要求公司支付工资及可能的经济补偿。

综上所述，自离的员工公司仍然应当支付其应得的工资。公司应当遵守劳动法律法规，按时足额支付员工工资；员工也应当了解自己的权益，并在必要时采取措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。