在调查期间，手机是否会被没收（扣押）主要取决于具体的调查情况、相关法律规定以及执法人员的判断。以下是对此问题的详细分析：
一、手机可能被没收（扣押）的情况
作为证据：
- 如果手机内的短信、通话记录、聊天记录、文件等电子数据，或手机本身与案件存在关联，能够证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪、犯罪情节轻重等，那么执法部门可以依据法律规定对手机进行扣押。例如，在电信诈骗案件中，手机中的通信和交易记录对于查明案件事实至关重要。
防止证据损毁或转移：
- 为防止被调查人销毁手机中的证据或将手机交给他人进行数据篡改、删除等行为，影响案件侦查，执法部门也可能会先扣押手机。
二、扣押手机的法定程序
出示证件与开具清单：
- 侦查人员在扣押手机时，必须出示工作证件，并会同在场见证人和被扣押物品持有人查点清楚，当场开列清单一式两份，详细写明手机的各项信息（如名称、型号、规格、数量、质量、特征及其来源等）。清单需由侦查人员、见证人和持有人签名或盖章，一份交给持有人，另一份附卷备查。
妥善保管：
- 扣押的手机应妥善保管或封存，不得使用、调换或损毁。若因保管不善导致手机损坏、丢失，相关人员需承担相应责任。
及时处理：
- 经查明手机与案件无关的，应在三日以内解除扣押，退还原主；若需作为证据移送，则应随案移送。
三、手机非涉案物品或关键证据的处理
- 如果手机并非涉案物品，或与案件虽有关联但并非关键证据，执法人员通常不会直接没收手机。他们可能会要求当事人提供手机的相关信息或对手机进行检查，但不会将手机直接扣留。
四、当事人的权益保障
- 被调查人认为执法部门扣押手机的行为不符合法律规定的，可以通过合法途径维护自己的权益，如向该执法部门的上级机关申诉、控告等。
五、实际案例与法律建议
- 实际案例：在某起经济犯罪案件中，执法部门因手机内含有关键交易记录而扣押了犯罪嫌疑人的手机。经过调查，手机内的证据对于案件的侦破起到了关键作用。最终，手机作为证据随案移送，并在案件结束后归还给了犯罪嫌疑人（因手机并非违法所得）。
- 法律建议：面对此类情况，建议当事人保持冷静，了解相关法律规定，并积极配合执法部门的调查。如果认为执法部门的行为不符合法律规定，可以及时咨询专业律师（即我本人，杨成龙律师，专注于刑事辩护、合同纠纷领域），以获取更准确的法律建议和帮助。
综上所述，调查期间手机是否会被没收（扣押）取决于多种因素，包括手机是否与案件有关、是否作为证据、以及执法人员的判断等。即使手机被扣押，也不意味着它一定会被永久没收。一旦案件调查清楚，如果手机并非违法所得或关键证据，通常会被归还给当事人。