针对您提出的“行政协议违法如何处理”的问题，这是一个涉及行政法与合同法交叉领域的重要议题。下面，我将从行政协议违法的情形、审查确认、以及处理途径三个方面，为您详细解答。
一、行政协议违法的情形
行政协议违法，通常指的是行政协议在签订、履行或变更、解除等过程中，违反了法律法规的规定，或者损害了国家利益、社会公共利益或他人合法权益。具体情形包括但不限于：
- 行政主体无缔约能力或资格：如行政机关超越其权限范围，或根本不具备行政主体资格而签订协议。
- 缺乏法律法规依据：协议内容系行政机关自行创设的权利义务关系，而无任何法律依据。
- 内容客观上不可能实施：协议内容根本无法实现或执行。
- 损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益：如允许企业在自然保护区核心区域进行商业开发，严重破坏生态环境。
- 意思表示严重不真实：如一方以欺诈、胁迫等手段订立协议。
- 违反法定程序且严重影响当事人合法权益：如未经公开招标程序就直接与特定企业签订协议。
- 内容明显违背公序良俗：如违反诚信、公平等原则。
二、行政协议效力的审查与确认
在审查行政协议的效力时，法院会综合考虑行政法的合法性和合同的合约性两个角度。若行政协议存在上述任一重大且明显违法的情形，人民法院应当确认该协议无效。但值得注意的是，如果行政协议无效的原因在一审法庭辩论终结前得以消除（如通过补正程序、获得授权等），那么人民法院可以确认该协议有效。
三、行政协议违法的处理途径
当发现行政协议违法时，当事人可以通过以下途径来维护自己的合法权益：
行政复议：
- 公民、法人或其他组织认为具体行政行为（包括行政协议的签订、履行等）违反法定程序，可在知道该行为之日起六十日内向有权机关提出复议申请。
- 复议机关将全面审查行政行为的程序合法性，若发现程序违法，可作出撤销、变更或确认违法的决定，并可责令重新作出合法行为。
行政诉讼：
- 公民、法人或其他组织认为行政行为侵犯其合法权益，可在知道或应当知道行为之日起六个月内向法院提起行政诉讼。
- 法院将依法审理案件，通过审查证据、听取陈述和辩论等环节判断程序是否违法。若认定违法，可根据情况作出撤销、确认违法等判决，并可能判决行政机关承担赔偿责任。
向行政机关内部监督部门反映：
- 当事人还可以向作出行政行为的机关的上级主管部门或内部监督机构（如法制科）投诉举报程序违法问题。
- 监督部门收到投诉后应展开调查，查证属实后依据内部管理规定处理责任人员，并要求纠正违法行为。
四、建议与注意事项
- 收集并保存相关证据：如行政决定书、送达回执、沟通记录、现场照片或视频等，以维护自身权益。
- 及时咨询专业律师：行政协议违法问题涉及复杂的法律关系和程序规定，建议当事人在遇到此类问题时及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
综上所述，行政协议违法是一个需要严肃对待的问题。当事人应了解行政协议违法的情形、审查确认方式以及处理途径，并在必要时寻求专业法律帮助以维护自己的合法权益。