停薪留职期间，劳动者与用人单位之间的劳动关系依然存在，只是处于中止履行的状态。以下是对这一结论的详细解释：
一、劳动关系存在的原因
合同层面：
- 停薪留职是劳动者与用人单位通过签订协议的方式约定的，劳动者在一定期限内离开工作岗位，但保留其员工身份。此期间，双方并没有解除劳动合同的合意，劳动合同并未实质性终止或解除。因此，劳动关系得以维持。例如，双方可能签订了停薪留职协议，明确约定了停薪留职的期限、待遇以及返岗条件等，这是劳动关系存续的重要依据。
权益与义务层面：
- 虽然劳动者在停薪留职期间不领取工资，但用人单位仍需为其保留人事档案，这是劳动关系存在的一个重要标志。同时，用人单位还需按照规定为劳动者缴纳社会保险等法定义务，而劳动者也享有如医疗期待遇等基于劳动关系产生的权益。这些权益和义务的存在，进一步证明了劳动关系的持续性。
法律规定层面：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，并应订立书面劳动合同。停薪留职并不影响劳动合同的效力，双方仍需遵守合同中的各项条款。此外，《工伤保险条例》也规定，职工因工作原因需要暂停工作接受医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，这进一步证明了劳动关系在停薪留职期间的持续性。
二、劳动关系状态
- 在停薪留职期间，劳动者与用人单位之间的劳动关系实际上处于中止履行的状态。劳动者因特定原因（如工伤、病假或其他个人原因）暂时离开工作岗位，但保留其职位和复工的权利。劳动合同在此期间仍然有效，双方保持着劳动权利义务关系，只是劳动者暂时不执行工作职责，并且工资发放暂停。
三、停薪留职期满后的处理
- 停薪留职期满后，劳动者应返回原单位复职。如果原单位无法安排工作或已撤销，应按照相关规定进行处理，可能涉及劳动合同的变更或解除。例如，双方可以协商变更劳动合同的内容，如调整工作岗位、降低工资等；或者协商解除劳动合同，并按照法律规定支付经济补偿金。
四、特殊情况
- 如果停薪留职协议中有明确约定双方劳动关系终止的条款，或者存在其他符合法定劳动关系终止的情形（如劳动者达到退休年龄、用人单位依法解散等），那么劳动关系可能会终止。具体情况需结合停薪留职协议的具体内容和相关法律法规来综合判断。
五、实例分析
以员工小张为例，他与公司签订了为期五年的劳动合同，工作两年后因个人原因申请停薪留职一年，公司同意并签订了停薪留职协议。在这一年期间，虽然小张没有工资收入，但公司依然为其缴纳社保，保留其人事档案。根据以上分析，小张与公司的劳动关系在停薪留职期间是持续存在的。停薪留职期满后，小张返回公司复职，继续履行劳动合同。
总结与建议：
停薪留职期间劳动关系是存在的，且双方需继续遵守劳动合同中的相关条款和约定。在处理停薪留职相关事宜时，应充分考虑法律法规的规定和双方的实际情况，以确保劳动关系的合法性和稳定性。如果双方对停薪留职期间的劳动关系存在争议，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。