若在本地持有烟草证，但运输超过五万元的烟草制品被抓，可能面临行政处罚甚至刑事处罚，具体取决于是否超出许可范围及情节严重程度。以下分情况详细说明：

1. 若运输行为未超出烟草专卖零售许可证的许可范围，但数量或金额较大

• 行政处罚风险：根据《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》第五十二条，若运输的烟草制品价值超过5万元，但未超出许可证规定的经营范围（如从合法渠道进货后运输至自有零售点），可能被认定为“无烟草专卖品准运证运输烟草专卖品”的违法行为。
  
  • 处罚措施：烟草专卖行政主管部门可没收违法运输的烟草制品，并处以违法运输烟草制品价值20%以上50%以下的罚款。
    
  • 关键点：需核实许可证是否允许跨区域运输（如从批发企业到零售点），若未违反地域限制，可能仅面临罚款；若违反（如跨市运输未备案），可能加重处罚。

2. 若运输行为超出烟草专卖零售许可证的许可范围（如无准运证、跨省运输或生产环节运输）

• 刑事处罚风险：根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条及《最高人民法院、最高人民检察院关于办理非法生产、销售烟草专卖品等刑事案件具体应用法律若干问题的解释》，若运输的烟草制品价值超过5万元，且存在以下情形之一，可能构成“非法经营罪”：
  
  • 无准运证运输：未取得烟草专卖品准运证而运输；
    
  • 超出许可范围：如零售户运输用于销售的烟草制品超出本地市场（跨省、市）；
    
  • 伪造、变造许可证：使用虚假证件运输。
    
  • 处罚措施：
    

       - 价值5万元以上不满50万元的，处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；  
       - 若存在其他严重情节（如多次运输、暴力抗法），可能加重处罚。
    

3. 特殊情形：运输假烟或走私烟

• 若运输的烟草制品为假冒注册商标或走私进口，无论是否持有烟草证，均可能同时触犯《刑法》第一百四十条（生产、销售伪劣产品罪）或第一百五十三条（走私普通货物、物品罪），处罚更严厉（如最高可处无期徒刑）。

建议行动

1. 立即核实许可证范围：确认运输行为是否在许可证允许的范围内（如地域、数量、用途）；
   
2. 保留进货凭证：证明烟草制品来源合法，避免被认定为“非法经营”；
   
3. 配合调查：如实说明运输目的、数量及来源，避免因隐瞒情节加重处罚；
   
4. 咨询专业律师：若涉及刑事风险，需尽快委托律师介入，争取从轻处理（如自首、立功、认罪认罚）。

如有进一步疑问或需具体法律帮助，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况提供详细方案。