结论：公司员工以借款名义补借条而拒不退还公司的代付款，这一行为是否违法，需根据具体情况来判断，但通常这种行为可能构成违法，甚至可能涉及刑事犯罪。

详细分析：

1. 民事法律关系角度：

   • 如果员工原本因公司业务需要而代公司支付了某些费用，之后以借款名义补写借条，但实际并无借款合意，且该费用本应由公司承担或已通过其他方式报销，那么员工拒不退还代付款的行为，可能构成不当得利。
   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不当得利是指没有合法根据，使他人受到损失而自己获得了利益。在此情况下，公司有权要求员工返还不当得利，即退还代付款。

2. 刑事法律关系角度：

   • 如果员工以非法占有为目的，通过虚构借款事实、伪造借条等手段，骗取公司财物，且数额较大，那么这种行为可能构成诈骗罪。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诈骗罪是指以非法占有为目的，用虚构事实或者隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物的行为。如果员工的上述行为符合诈骗罪的构成要件，那么公司可以向公安机关报案，要求追究员工的刑事责任。

3. 实际操作建议：

   • 公司应首先与员工进行沟通，了解员工拒不退还代付款的具体原因和背景，尝试通过协商解决问题。
   • 如果协商无果，公司可以收集相关证据，如代付款凭证、借条、员工的工作记录等，以证明员工的不当得利或诈骗行为。
   • 根据证据情况，公司可以选择向法院提起民事诉讼，要求员工返还不当得利；或者向公安机关报案，要求追究员工的刑事责任。

后续行动建议：

• 在处理此类问题时，公司应确保所有操作都符合法律法规的规定，避免采取过激或违法的手段。
• 如果公司对法律程序不熟悉或担心处理不当，可以寻求专业律师的帮助，以确保公司的权益得到充分保护。

可能法律后果：

• 如果员工的行为被认定为不当得利，那么员工需要承担返还不当得利的民事责任。
• 如果员工的行为被认定为诈骗罪，那么员工可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等。

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