请病假扣底薪是否合法，需根据具体情况综合判断。以下是对此问题的全面分析与解答：
合法扣减情况
符合法定标准：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费。
- 病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。若企业按照这一标准扣减病假职工的底薪（这里底薪若指基本工资，且该基本工资不低于当地最低工资标准的80%时，扣减后的部分仍符合病假工资支付标准），则是合法的。例如，某地最低工资标准为2000元/月，员工底薪为2500元/月，病假期间公司支付底薪的80%即2000元，这符合法定标准，是合法的。
企业内部规章制度：
- 若单位依法制定的规章制度中明确规定了请病假的扣薪标准，且该标准不低于当地最低工资标准的一定比例（通常为80%），同时规章制度的制定需经过民主程序并向劳动者公示。在这种情况下，企业按照规章制度扣减病假底薪也是合法的。比如，公司规章制度规定病假期间底薪按80%发放，且该制度经过职工代表大会讨论通过并公示，那么公司按照此规定执行是合法的。
劳动合同或集体合同约定：
- 如果劳动合同或集体合同中有关于病假工资的明确约定，且约定标准高于法定标准或企业内部规章制度标准，企业应当按照约定执行，此时的扣减行为也是合法的。例如，劳动合同中约定病假期间底薪全额发放，那么公司就应按照此约定执行。
不合法扣减情况
低于法定标准：
- 如果企业扣减病假职工的底薪低于当地最低工资标准的80%，则这种行为是不合法的。比如，当地最低工资标准为2000元/月，公司扣减后病假期间底薪仅为1500元/月，这就低于了法定标准，是不合法的。
无规章制度或未公示：
- 如果单位没有相关规章制度，或者规章制度的制定未经过民主程序且未向劳动者公示，就随意扣发病假底薪，这也是违法的。例如，公司从未制定过关于病假扣薪的规章制度，也未向员工公示过相关内容，却擅自扣减员工病假期间的底薪，这是不合法的。
违反劳动合同或集体合同：
- 如果企业违反劳动合同或集体合同中关于病假工资的明确约定，扣减病假底薪，则同样是不合法的。比如，劳动合同中明确约定病假期间底薪不得扣减，但公司却擅自扣减，这就违反了合同约定，是不合法的。
无故克扣工资：
- 如果员工请病假期间，公司未按照法律法规或劳动合同约定支付底薪，而是无故克扣员工应得的底薪（如将底薪全部扣除或按事假标准扣工资等），这种行为也是不合法的。例如，员工请病假，公司却按照事假标准扣除全部底薪，这是不合法的。
应对措施
- 劳动者在认为用人单位扣病假底薪行为违法时，首先应与用人单位协商沟通，要求其按照规定支付底薪。
- 若协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
综上所述，请病假扣底薪是否合法取决于多种因素的综合判断。在遇到相关问题时，你可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况，为你提供更准确的法律意见，并帮助你依法维护自己的合法权益。