结论：分包人明知总包是挂靠关系的，工程款的主张对象需根据具体情况来确定，一般可向被挂靠方（即名义上的总承包人）主张，若挂靠方与被挂靠方有明确约定或法律另有规定，也可能向挂靠方主张，或者同时向两者主张。以下是对此问题的详细分析：
一、向被挂靠方主张工程款
法律依据：
- 在挂靠关系中，被挂靠方作为名义上的总承包人，往往与发包方签订了建设工程施工合同。根据合同相对性原则，分包人作为与总承包人（实际为被挂靠方，但分包人明知是挂靠关系）存在合同关系的相对方，有权依据合同向被挂靠方主张工程款。
- 此外，从保护善意第三人（在此情境下，分包人虽明知挂靠关系，但法律上仍可能将其视为相对善意的合同相对方，因其并非挂靠关系的直接参与者）和维护交易安全的角度出发，法律也倾向于允许分包人向被挂靠方主张权利。
实践操作：
- 分包人应收集并整理与被挂靠方签订的分包合同、工程进度单、验收报告等证据材料，以证明其已完成合同约定的工程任务且工程质量符合要求。
- 分包人可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式向被挂靠方主张工程款。在诉讼过程中，分包人需证明被挂靠方为合同相对方且未履行付款义务。
二、向挂靠方主张工程款
特殊情况：
- 若挂靠方与被挂靠方之间有明确约定，挂靠方承担向分包人支付工程款的义务，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，则分包人可依据该约定向挂靠方主张工程款。
- 在某些情况下，挂靠方可能直接参与工程管理，与分包人形成事实上的合同关系。此时，分包人也可基于事实合同关系向挂靠方主张工程款。
实践操作：
- 分包人需收集并整理与挂靠方之间的往来函件、会议纪要、付款凭证等证据材料，以证明其与挂靠方之间存在事实上的合同关系或挂靠方有支付工程款的义务。
- 在主张权利时，分包人需注意区分挂靠方与被挂靠方的法律责任，避免将两者混为一谈。
三、同时向挂靠方和被挂靠方主张工程款
法律依据与理论支持：
- 在某些复杂情况下，挂靠方与被挂靠方可能共同参与了工程管理或资金运作，导致两者在工程款支付方面存在连带责任。此时，分包人可依据相关法律规定或合同约定，同时向挂靠方和被挂靠方主张工程款。
- 从保护分包人合法权益的角度出发，法律也允许在特定情况下突破合同相对性原则，要求挂靠方与被挂靠方承担连带责任。
实践操作与风险防范：
- 分包人在同时向挂靠方和被挂靠方主张工程款时，需充分收集并整理相关证据材料，以证明两者在工程款支付方面存在连带责任。
- 分包人还需注意诉讼策略的选择和风险防范。例如，在起诉时可将挂靠方和被挂靠方列为共同被告；在执行过程中可申请追加被执行人或采取其他执行措施以确保债权实现。
建议：分包人在面临此类问题时，应首先收集并整理相关证据材料，明确合同相对方和付款义务人；其次，根据具体情况选择合适的法律途径和诉讼策略来主张权利；最后，在诉讼过程中保持谨慎和理性，避免盲目行动或忽视风险防范。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。