面对分公司负责人变更而总公司不配合的情况，你可以采取以下策略来应对：

1. 初步沟通与了解原因

   • 主动沟通：首先，尝试与总公司相关负责人进行坦诚的沟通，了解他们不配合变更的具体原因。这可能涉及对变更的必要性存疑、内部管理流程问题、对新负责人资质有担忧等多种因素。通过正式会议、面谈或书面函件等方式进行沟通，确保信息传达的准确性和正式性。
   • 明确问题：在沟通过程中，要耐心倾听总公司的意见和顾虑，并尝试明确问题的症结所在。这有助于你更有针对性地解决问题，提高沟通效率。

2. 依据公司章程和相关规定沟通协商

   • 查阅章程：仔细研究总公司和分公司的公司章程，确认关于分公司负责人变更的具体规定和流程。这将为你后续的沟通协商提供有力的法律依据。
   • 强调合规性：以书面形式向总公司详细说明变更的法律依据、必要性和紧迫性。你可以引用相关法律法规和公司章程中的条款，强调变更的合规性和必要性，争取总公司的理解和支持。
   • 内部协调：如果直接沟通无果，你可以尝试向总公司内部其他有影响力的高层领导反映情况，或者借助分公司股东的力量进行沟通和协商。通过内部协调，有时可以更有效地解决问题。

3. 考虑法律途径

   • 发送律师函：如果沟通协商无果，你可以考虑委托专业律师向总公司发送律师函。律师函中应明确指出不配合变更可能面临的法律后果，如行政处罚、民事赔偿等，通过法律威慑促使总公司改变态度。
   • 提起诉讼：作为最后的手段，你可以考虑向法院提起诉讼，请求变更公司登记纠纷。在诉讼过程中，你需要准备齐全的变更登记申请书、经办人身份证明、企业申请登记委托书、营业执照正副本、任免文件及新负责人身份证明等材料。如果法院认定总公司行为违法，可以判决强制变更公司负责人。

4. 注意事项

   • 分公司法律地位：在处理过程中，要明确分公司不具有独立法人资格，其民事责任由总公司承担。因此，负责人的任命需依据总公司决议，确保变更的合法性和有效性。
   • 变更流程合规性：确保变更过程严格遵守《中华人民共和国公司法》及其他相关法律法规，包括提交变更申请、提供相关证明和任职文件等。任何违规操作都可能导致变更无效或面临法律风险。
   • 保留证据：在处理过程中，注意保留与总公司沟通的相关记录，如邮件、函件、会议纪要等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用，有助于证明你的立场和诉求。

在处理分公司负责人变更而总公司不配合的问题时，建议你保持冷静和理性，综合运用沟通协商、内部协调、法律威慑及诉讼等多种手段来解决问题。 同时，确保整个变更过程的合法性和规范性，以保护双方的合法权益。如果你在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。