结论：购销协议中合同底部只有乙方盖章而甲方签字的情况，在法律上并不必然导致合同无效，但可能会影响合同的证明力和执行效率。具体是否有效及后续处理方式，需结合实际情况判断。以下从多个角度进行分析：

1. 合同成立与生效的基本原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同成立一般需要双方意思表示一致，即通常所说的“要约”与“承诺”。在书面合同中，这通常体现为双方的签字或盖章。
   • 合同的生效则可能受到更多因素的影响，如合同内容是否合法、是否违反公序良俗、是否具备法定形式等。但就签字盖章而言，并非所有合同都必须同时具备签字和盖章才生效，这取决于合同的具体约定和法律规定。

2. 签字与盖章的法律效力：

   • 签字和盖章都是表示合同当事人意思表示的方式，具有同等的法律效力。在合同中，只要有一方（无论是甲方还是乙方）以签字或盖章的方式表示了同意合同内容，且该意思表示真实、合法，那么该方就应当受到合同的约束。
   • 在您描述的情况下，甲方已经签字，这通常被视为甲方对合同内容的认可和接受。乙方盖章则进一步确认了乙方的意思表示。因此，从形式上看，这份合同已经具备了双方意思表示一致的要件。

3. 可能存在的问题与风险：

   • 证明力问题：虽然甲方签字和乙方盖章在法律上具有同等效力，但在实际纠纷中，如果只有一方盖章而另一方签字，可能会引发关于合同真实性和完整性的争议。例如，如果甲方主张其签字是在被胁迫或欺诈的情况下作出的，那么合同的证明力就会受到质疑。
   • 执行效率问题：在合同履行过程中，如果双方对合同内容产生争议，且合同形式上存在瑕疵（如只有一方盖章），那么这可能会影响争议的解决效率和结果。例如，在诉讼或仲裁中，法院或仲裁机构可能需要花费更多时间来审查合同的真实性和有效性。

4. 建议与措施：

   • 完善合同形式：为了避免潜在的纠纷和风险，建议双方在签订合同时尽量确保合同形式上的完备性。即，既要有甲方的签字，也要有乙方的盖章（或反之）。如果确实存在只有一方盖章而另一方签字的情况，可以考虑在合同中明确说明这一情况，并附上相关证据（如签字人的身份证明、授权委托书等）以增强合同的证明力。
   • 保留证据：无论是签字还是盖章，双方都应当妥善保管相关证据（如合同原件、签字或盖章的样本等）。这些证据在后续争议解决中可能起到关键作用。
   • 及时沟通：如果在合同履行过程中发现任何问题或争议，双方应当及时沟通并寻求解决方案。通过友好协商或调解等方式解决争议，往往比通过诉讼或仲裁等法律途径更加高效和经济。

总结：购销协议中只有乙方盖章而甲方签字的情况，在法律上并不必然导致合同无效。但为了避免潜在的纠纷和风险，建议双方在签订合同时尽量确保合同形式上的完备性，并妥善保管相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。