结论：员工病假两年后协商解除劳动合同的薪资标准计算，主要依据《劳动合同法》及相关规定，并结合员工的实际工资情况、病假期间的工资支付情况以及协商解除的具体条款来确定。以下从不同角度详细分析：

1. 基本薪资标准：

   • 根据《劳动合同法》的规定，协商解除劳动合同时，用人单位应按照员工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付经济补偿。这里的“月工资”是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
   • 如果员工在病假期间，其工资支付可能低于正常工作期间的工资，那么在计算经济补偿时，应以其病假前的正常工资水平或双方协商确定的工资水平作为参考，但具体还需根据实际情况和协商结果来确定。

2. 病假期间工资支付的影响：

   • 病假期间，员工的工资支付通常按照用人单位的规章制度或劳动合同的约定来执行，可能低于正常工作期间的工资。然而，在计算协商解除劳动合同的经济补偿时，不能简单地将病假期间的工资作为计算基础。
   • 如果双方能够就经济补偿的薪资标准达成一致，那么应按照协商的结果来执行。如果无法达成一致，则可能需要通过劳动仲裁或诉讼来解决争议。

3. 协商解除的具体条款：

   • 协商解除劳动合同的过程中，双方可以就经济补偿的薪资标准、支付方式、支付时间等具体条款进行协商。这些条款一旦达成一致，就具有法律效力，双方应严格遵守。
   • 如果协商过程中无法就薪资标准达成一致，那么应参考相关法律法规的规定，并结合员工的实际情况和用人单位的规章制度来确定。

4. 实际操作建议：

   • 在协商解除劳动合同前，建议用人单位和员工都充分了解相关法律法规的规定，以及双方的权益和义务。
   • 双方可以就经济补偿的薪资标准进行充分沟通，尽量达成一致意见。如果无法达成一致，可以寻求第三方调解或咨询专业律师的意见。
   • 在签订协商解除劳动合同的协议时，应明确经济补偿的薪资标准、支付方式、支付时间等具体条款，以避免后续争议。

示例说明： 假设员工在病假前正常工作期间的月工资为8000元，病假期间按照用人单位的规章制度每月支付4000元病假工资。在协商解除劳动合同时，如果双方同意按照员工病假前的正常工资水平来计算经济补偿，那么经济补偿的月工资标准就是8000元。如果员工在本单位工作了5年，那么用人单位应支付的经济补偿就是5个月×8000元/月=40000元。

特殊情况说明：

• 如果员工在病假期间有特殊的工资支付安排（如按照一定比例支付、有额外的补贴等），那么在计算经济补偿时，应将这些因素考虑在内。
• 如果双方在协商解除劳动合同的过程中，对经济补偿的薪资标准有争议且无法达成一致，那么可能需要通过劳动仲裁或诉讼来解决。在这个过程中，法院或仲裁机构会根据相关法律法规的规定和双方的实际情况来作出裁决。

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