结论：百分之百控股的母公司法人变更了，被控股的公司法人并不会自然变更。

详细解释：

1. 法人变更的独立性：

   • 法人变更是指公司法定代表人的变更，这是一个独立的法律行为。母公司和被控股公司作为两个独立的法人实体，它们的法人变更并不具有联动性。也就是说，母公司的法人变更不会自动导致被控股公司的法人变更。

2. 公司章程与股东会决议：

   • 被控股公司的法人变更需要依据其公司章程的规定，并经过股东会或董事会的决议。即使母公司是被控股公司的唯一股东，也需要按照法定程序进行决议，并办理相应的工商变更登记手续。

3. 实际操作流程：

   • 如果母公司希望变更被控股公司的法人，它需要向被控股公司提出变更请求，并按照被控股公司的公司章程和法律法规的规定，召开股东会或董事会，形成变更法人的决议。
   • 随后，被控股公司需要向工商行政管理部门提交变更申请，包括变更决议、新任法定代表人的身份证明等文件，完成工商变更登记手续。

4. 法律后果与责任：

   • 如果母公司未经被控股公司同意或未按照法定程序变更其法人，可能会引发法律纠纷，甚至承担法律责任。因为这种行为可能侵犯了被控股公司的自主经营权和其他股东的合法权益。

建议与注意事项：

• 遵循法定程序：在进行法人变更时，务必遵循公司章程和法律法规的规定，确保变更程序的合法性和有效性。
• 保护股东权益：在变更过程中，要充分保护所有股东的合法权益，避免因为变更行为而引发不必要的法律纠纷。
• 及时办理工商变更登记：完成法人变更后，要及时向工商行政管理部门办理变更登记手续，确保公司信息的准确性和时效性。

如果您在母公司或被控股公司的法人变更过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。