结论：上班两个月后去申请劳动仲裁，您依然可以依法维护自己的合法权益，包括但不限于要求支付未签订劳动合同的双倍工资差额、拖欠的工资、经济补偿金等。下面我将从多个角度为您详细分析。
一、劳动仲裁的基本流程与上班时长无关
劳动仲裁是解决劳动争议的一种法定方式，其基本流程包括提交仲裁申请、受理、开庭审理、裁决等步骤。这一流程并不受您上班时长的影响，无论您上班多久，只要存在劳动争议，都可以依法申请劳动仲裁。
二、上班两个月可能涉及的仲裁请求
未签订劳动合同的双倍工资差额：
- 根据《劳动合同法》的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。因此，如果您上班两个月且未签订劳动合同，您可以要求用人单位支付一个月的双倍工资差额。
拖欠的工资：
- 如果用人单位存在拖欠您工资的情况，无论您上班多久，都可以要求用人单位支付拖欠的工资，并可能要求支付拖欠工资的赔偿金。
经济补偿金：
- 如果用人单位存在违法解除劳动合同等情形，您可能还有权要求用人单位支付经济补偿金。经济补偿金的计算通常与您的工作年限和月工资有关，但即使上班两个月，也可能根据具体情况获得一定的经济补偿。
三、申请劳动仲裁的注意事项
证据收集：
- 在申请劳动仲裁前，您需要收集相关证据来支持您的仲裁请求。这包括但不限于工资条、工作证、考勤记录、与用人单位的沟通记录等。这些证据将有助于证明您的劳动关系、工作时长以及用人单位的违法行为。
仲裁时效：
- 劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从您知道或者应当知道权利被侵害之日起计算。因此，您需要在时效期间内及时申请劳动仲裁，以免丧失维权机会。
仲裁申请书的撰写：
- 仲裁申请书是申请劳动仲裁的重要文件，您需要清晰、准确地陈述您的仲裁请求、事实和理由。如果您不熟悉仲裁申请书的撰写，可以寻求专业律师的帮助。
四、后续行动建议
与用人单位协商：
- 在申请劳动仲裁前，您可以尝试与用人单位进行协商，看是否能够达成和解。这有助于节省时间和精力，并可能更快地解决问题。
寻求法律援助：
- 如果您在申请劳动仲裁过程中遇到困难或疑问，可以寻求法律援助或咨询专业律师。我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。
最后，上班两个月后去申请劳动仲裁并不影响您依法维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。