开发商协商退房扣百分之二十违约金是否合法，不能一概而论，需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：
合同约定角度
- 若合同中有明确约定退房违约金比例：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。如果购房合同中明确约定了退房时开发商可以扣除百分之二十的违约金，且该约定不违反法律法规的强制性规定（比如不存在显失公平、欺诈、胁迫等情形），那么开发商扣除百分之二十违约金的行为是合法的。例如，购房合同中写明“若购房者因自身原因要求退房，需向开发商支付房屋总价款百分之二十的违约金”，在这种情况下，开发商按照合同约定扣除违约金是合理合法的。
- 若合同中未明确约定退房违约金比例：此时开发商不能随意扣除百分之二十的违约金。双方应先进行协商，若协商不成，开发商要求支付违约金的，需要证明因购房者退房给自己造成了实际损失，并且该损失与扣除的百分之二十违约金相当。如果开发商无法证明实际损失情况，那么其扣除百分之二十违约金的要求可能得不到法律支持。
实际损失角度
即使合同中有约定违约金比例，但如果开发商主张的违约金过分高于其实际损失，根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条第二款规定，约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。一般来说，违约金的数额以不超过实际损失的百分之三十为限。例如，开发商因购房者退房实际遭受的损失只有房屋总价款的百分之五，而合同约定扣除百分之二十的违约金，这种情况下购房者可以请求法院或仲裁机构减少违约金数额。
特殊情况角度
如果是因为开发商的原因导致购房者要求退房，比如开发商存在欺诈行为、未按照合同约定交付房屋、房屋存在严重质量问题等，那么购房者不仅不需要支付违约金，还可以要求开发商承担违约责任，赔偿自己的损失。在这种情况下，开发商扣除百分之二十违约金的行为显然是不合法的。
给你的建议：
- 首先仔细查看购房合同中关于退房违约金的约定条款。
- 如果认为开发商扣除的违约金不合理，可以收集相关证据，如开发商实际损失的证明材料等，与开发商再次协商。
- 若协商无果，你可以通过向法院起诉或者申请仲裁的方式来解决纠纷，维护自己的合法权益。
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