结论：是否应该辞职不能一概而论，需结合违规操作的性质、公司调查结果、个人职业规划及法律风险等多方面因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、违规操作的性质与后果
轻微违规：如果违规操作情节轻微，未对公司造成实质性损失，且公司调查后未给予严厉处分（如仅口头警告、书面警告等），那么辞职可能并非必要选择。此时，你可以考虑与公司沟通，表达改正的决心，并努力提升自己的职业素养，以避免类似情况再次发生。
严重违规：如果违规操作情节严重，如涉及贪污、挪用资金、泄露商业秘密等违法行为，或者给公司造成了重大损失，那么公司可能会采取更严厉的处分措施，如解除劳动合同、追究法律责任等。在这种情况下，即使你不主动辞职，公司也可能根据相关规定解除与你的劳动关系。此时，你需要做好应对法律后果的准备，并考虑是否需要寻求法律援助。
二、公司调查结果与处理态度
调查结果公正：如果公司调查过程公正、透明，且处理结果符合公司规章制度和法律法规要求，那么你可以根据调查结果和公司处理态度来决定是否辞职。如果公司给予了合理的处分，并且你认可这一结果，那么可以考虑继续留在公司工作；如果公司处理过重或存在不公正之处，你可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
调查结果存疑：如果公司调查过程存在不公正、不透明之处，或者调查结果与事实不符，那么你可以向公司提出异议，并要求重新调查或申诉。在此过程中，你可以咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到保障。如果公司坚持不合理的处理结果，你可以考虑辞职并寻求其他就业机会。
三、个人职业规划与法律风险
职业规划：你需要考虑自己的职业规划和发展前景。如果违规操作对你的职业生涯造成了严重影响，或者你担心未来在公司的发展会受到限制，那么辞职可能是一个合理的选择。然而，在做出决定之前，你需要评估自己的市场竞争力、就业前景以及新工作的稳定性等因素。
法律风险：你还需要考虑违规操作可能带来的法律风险。如果违规操作涉及违法行为，你可能会面临法律责任和处罚。在这种情况下，辞职并不能完全消除法律风险，但你可以通过积极配合调查、主动承担责任等方式来减轻法律后果。同时，你也可以咨询专业律师的意见，以了解自己的法律权益和义务。
四、建议与行动
与公司沟通：在决定是否辞职之前，建议你与公司进行充分沟通，了解公司对违规操作的处理态度和结果。通过沟通，你可以更好地了解公司的期望和要求，以及自己在职场中的定位和发展方向。
咨询专业律师：如果你对违规操作的法律后果、公司的处理结果或自己的权益保障存在疑问，建议你咨询专业律师的意见。律师可以根据你的具体情况提供针对性的法律建议和帮助，以维护你的合法权益。
评估与决策：在充分了解情况并咨询专业律师的意见后，你需要对自己的职业规划、法律风险以及个人价值观进行综合评估，并做出明智的决策。无论你选择辞职还是继续留在公司工作，都需要做好充分的准备和规划，以确保自己的职业生涯能够顺利发展。
最后，面对被公司调查后本人违规操作的情况，是否应该辞职需要综合考虑多方面因素。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。