若国家审计查到施工企业存在违法转包的情况，施工企业将面临行政处罚、民事赔偿风险，还可能涉及刑事责任，同时需要积极配合审计并整改。以下从不同角度详细分析：
行政责任角度
- 处罚依据：根据《中华人民共和国建筑法》第六十七条第一款规定，承包单位将承包的工程转包的，或者违反本法规定进行分包的，责令改正，没收违法所得，并处罚款，可以责令停业整顿，降低资质等级；情节严重的，吊销资质证书。同时，《建设工程质量管理条例》第六十二条也明确，违反本条例规定，承包单位将承包的工程转包或者违法分包的，责令改正，没收违法所得，对勘察、设计单位处合同约定的勘察费、设计费25%以上50%以下的罚款；对施工单位处工程合同价款0.5%以上1%以下的罚款；可以责令停业整顿，降低资质等级；情节严重的，吊销资质证书。
- 应对措施：施工企业应积极配合审计工作，如实提供相关资料和信息。在收到处罚通知后，若对处罚有异议，可在规定时间内申请行政复议或提起行政诉讼。若认可处罚，应及时缴纳罚款，按照要求停业整顿、降低资质等级等，并制定整改计划，确保后续不再出现违法转包行为。
民事责任角度
- 责任承担：违法转包可能导致工程质量问题，给建设单位造成损失。根据《中华人民共和国民法典》第八百零六条规定，承包人将建设工程转包、违法分包的，发包人可以解除合同。发包人解除合同后，如果因承包人转包导致工程质量不符合约定的，发包人有权请求承包人承担修复费用；逾期交付使用或者存在其他侵权行为给发包人造成损失的，承包人应当赔偿损失。此外，实际施工人因转包人拖欠工程款等问题，也可能将转包的施工企业诉至法院，要求其承担付款责任。
- 应对措施：施工企业应积极与建设单位沟通协商，承担因违法转包导致的修复费用和损失赔偿责任。对于实际施工人的诉求，应审查相关合同和付款凭证，按照法律规定和合同约定进行处理。若存在争议，可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。
刑事责任角度
- 犯罪情形：如果违法转包行为导致重大安全事故，构成犯罪的，根据《中华人民共和国刑法》第一百三十七条规定，建设单位、设计单位、施工单位、工程监理单位违反国家规定，降低工程质量标准，造成重大安全事故的，对直接责任人员，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；后果特别严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
- 应对措施：施工企业应立即采取措施防止事故扩大，保护事故现场，并及时向有关部门报告。积极配合事故调查工作，如实提供相关情况。若涉及刑事责任，应委托专业律师进行辩护，争取从轻或减轻处罚。
整改与预防角度
- 整改措施：施工企业应全面清理现有的转包项目，终止违法转包行为。对已完工的项目，进行质量复查，确保工程质量符合标准。加强内部管理，建立健全项目管理制度，明确项目管理的责任和流程，加强对项目人员的培训和教育，提高法律意识和业务水平。
- 预防措施：在今后的项目承接中，严格遵守法律法规和合同约定，不得将工程转包或违法分包。加强对分包单位的管理和监督，选择具有相应资质和良好信誉的分包单位，签订详细的分包合同，明确双方的权利和义务。定期对项目进行自查自纠，及时发现和解决问题，避免违法违规行为的发生。
如果国家审计已经查到施工企业违法转包，建议施工企业及时寻求专业法律帮助，以便更好地应对可能面临的法律风险。你可以直接向我咨询相关法律问题，我会为你提供详细、专业的解答。