关于氨基酸水溶肥料中添加海藻糖是否合法的问题，这主要取决于该肥料产品是否已经按照相关规定进行了登记，并且其成分、含量等是否与登记批准的内容相符。

首先，我们需要明确的是，任何肥料产品，包括氨基酸水溶肥料，在生产、销售前都需要进行登记，并获得相应的登记证号。登记过程中，会对肥料的成分、含量、适用作物、使用方法等进行详细的规定和审核。因此，如果氨基酸水溶肥料在登记时并未包含海藻糖这一成分，那么在后续的生产、销售过程中添加海藻糖，就可能构成与登记批准内容不符的违法行为。

从您提供的参考信息中，我们可以看到两个行政处罚的案例，它们都涉及到了肥料产品与登记批准内容不符的问题。第一个案例中，肥料产品的游离氨基酸含量不符合标明值要求，被判定为不合格；第二个案例中，肥料产品的标签内容被擅自修改，与登记批准的内容不一致，同样受到了处罚。这两个案例都说明了，肥料产品的成分、含量等必须与登记批准的内容相符，否则就可能面临法律处罚。

因此，对于氨基酸水溶肥料中添加海藻糖的问题，如果该肥料在登记时并未包含海藻糖，那么添加海藻糖就是不合法的。如果想要添加海藻糖，就需要重新进行登记申请，并获得相应的登记证号。

总的来说，氨基酸水溶肥料中添加海藻糖是否合法，取决于该肥料是否已经按照相关规定进行了登记，并且其成分、含量等是否与登记批准的内容相符。如果未经登记或登记内容与实际不符，就可能构成违法行为。因此，建议肥料生产、销售企业在生产、销售前务必仔细核对登记内容，确保产品的合法性和合规性。