国企员工违纪是否要扣年终奖，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同及规章制度的角度
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确规定了员工违纪时可以扣除年终奖，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位有权依据合同约定扣除违纪员工的年终奖。
规章制度规定：
- 用人单位的规章制度中如果明确规定了员工违纪的处罚措施，包括扣除年终奖，且该规章制度已经过民主程序制定、公示或告知员工，那么用人单位也有权依据规章制度扣除违纪员工的年终奖。
二、违纪行为的性质与程度
严重违纪：
- 如果员工的违纪行为严重违反了用人单位的规章制度或劳动纪律，如贪污、盗窃、严重失职等，用人单位不仅有权扣除年终奖，还可能解除劳动合同。
一般违纪：
- 对于一般违纪行为，如迟到、早退、轻微违反工作纪律等，用人单位通常不会直接扣除年终奖，但可能会根据违纪情况给予警告、罚款等其他处罚。
三、年终奖的性质与发放条件
年终奖的性质：
- 年终奖是用人单位根据自身经营状况和员工表现给予的一种奖励，并非员工的固定工资组成部分。因此，用人单位在发放年终奖时具有一定的自主权。
发放条件：
- 如果年终奖的发放条件与员工的表现、业绩等挂钩，且员工的违纪行为影响了其表现或业绩，那么用人单位有权根据实际情况调整或扣除年终奖。
四、法律建议与风险提示
法律建议：
- 用人单位在制定规章制度或劳动合同中关于年终奖的条款时，应明确、具体、合法，避免模糊不清或违反法律法规的强制性规定。
- 员工在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于年终奖的约定，确保自己的权益得到保障。
风险提示：
- 如果用人单位未经合法程序制定规章制度或劳动合同中关于年终奖的条款，或扣除年终奖的行为违反了法律法规的强制性规定，员工有权向劳动争议仲裁委员会或人民法院提起诉讼，要求用人单位支付被扣除的年终奖。
总结来说，国企员工违纪是否要扣年终奖，需根据劳动合同、规章制度、违纪行为的性质与程度以及年终奖的性质与发放条件等多方面因素综合判断。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。