结论：是否因违反劳动纪律就不发年终奖，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
劳动合同或规章制度有明确约定的情况
- 法律性质：若劳动合同中明确规定了年终奖的发放条件、金额、时间等，或者企业规章制度（经过民主程序制定且已向员工公示）对年终奖有详细规定，那么年终奖即成为员工工资福利待遇的一部分，属于劳动报酬的组成部分。
- 法律后果：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十九条和第三十条，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定全面履行各自的义务，包括及时足额支付劳动报酬。若企业无正当理由不按照约定或规定发放年终奖，即违反了法律规定。此时，即使员工违反了劳动纪律，企业也不能以此为由拒绝发放年终奖，除非劳动合同或规章制度中明确将违反劳动纪律列为不发放年终奖的情形。
- 处理方式：员工可以向当地劳动行政部门投诉举报，请求劳动局介入处理；也可以申请劳动仲裁或提起诉讼，要求企业按照约定或规定发放年终奖。
劳动合同或规章制度无明确约定的情况
- 企业自主权：若劳动合同和规章制度中均未对年终奖作出明确约定，那么年终奖的发放就属于企业自主管理和经营决策的范畴。企业可以根据自身的经营状况、员工的工作表现等因素来决定是否发放以及发放的金额。
- 公平合理原则：尽管企业有自主决定权，但在决定是否发放年终奖时，仍需遵循公平合理的原则。不能随意歧视或恶意克扣部分员工的年终奖。若员工能够提供证据证明企业在年终奖发放上存在不合理的差别对待，如因违反劳动纪律而恶意克扣年终奖，且该行为违反了企业内部的公平原则或行业惯例，员工可以通过法律途径维护自己的权益。
- 处理建议：在此情况下，员工应首先尝试与用人单位协商解决，要求用人单位按照公平合理原则发放年终奖。若协商无果，且员工认为企业的行为违反了公平合理原则，可以收集相关证据，如工资单、工作表现记录、企业规章制度等，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
综合建议：
- 收集证据：无论是否有明确约定，员工都应妥善保存劳动合同、工资单、公司规章制度等相关证据，以备不时之需。
- 协商解决：在发现年终奖发放问题后，员工应首先尝试与用人单位协商解决，要求用人单位按照约定或公平合理原则发放年终奖。
- 法律途径：若协商无果，且员工认为自己的权益受到侵害，可以向当地劳动行政部门投诉举报，或申请劳动仲裁、提起诉讼来维护自己的合法权益。
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