在婚姻存续期间购买房产并签订份额归属权协议，若要确保其有效，需满足以下核心条件：

1. 协议形式合法
   根据《民法典》第1065条，夫妻财产约定需采用书面形式，口头约定无效。协议应明确记载双方姓名、身份证号、房产信息（地址、产权证号）、份额比例（如各占50%）及签署日期，并由双方签字确认。若涉及公证，可进一步增强证明力，但公证并非强制要求。

2. 协议内容不违反法律强制性规定

   • 份额分配需符合公序良俗，例如不得约定“一方完全放弃所有权，另一方独占”但未支付合理对价（可能被认定为赠与或显失公平）。
     
   • 若房产涉及贷款，需确保份额约定不影响银行抵押权（如银行同意变更借款人或共有人）。
     
   • 不得通过份额约定逃避债务（如恶意转移财产损害债权人利益），否则可能被法院撤销。

3. 产权登记与协议一致
   根据《民法典》第209条，不动产物权以登记为准。若协议约定按份共有（如甲60%、乙40%），需在房产证“共有情况”栏明确登记份额。若仅协议约定但未变更登记，可能面临以下风险：

   • 第三方（如债权人）可能主张房产为共同共有，要求执行全部产权；
     
   • 离婚分割时，法院可能结合登记情况、出资贡献等因素综合判断份额。

4. 双方意思表示真实
   协议需在自愿、平等基础上签订，避免存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。例如：

   • 若一方以离婚为条件威胁签署，协议可能被撤销；
     
   • 若一方隐瞒房产实际价值（如低价约定份额），可能构成显失公平。

特殊情形提示：

• 父母出资购房：若一方父母部分出资，需明确出资性质（赠与或借款）及是否约定份额。根据《民法典婚姻家庭编解释（一）》第29条，婚后父母出资原则上视为对双方的赠与，除非明确约定仅赠与一方。
  
• 涉及第三人权益：若房产已抵押或出租，需确保份额约定不损害抵押权人或承租人利益，否则可能影响协议效力。

建议操作步骤：

1. 签订书面协议并公证（非必须但推荐）；
   
2. 携带协议、身份证、结婚证、房产证至不动产登记中心办理份额变更登记；
   
3. 保留购房合同、付款凭证等出资证据，以备后续争议时举证。
   

如有具体协议条款或案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。