关于事业编工作人员周末加班是否可以发加班工资的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来细致分析。以下是我为您提供的详细解答：

一、单位性质与劳动关系是关键

首先，我们需要明确事业编工作人员所在的单位性质以及他们与单位建立的劳动关系。事业编工作人员可能分布在参公管理的事业单位、公益一类事业单位、公益二类事业单位等不同类型中，且他们与单位的关系可能属于人事管理关系或劳动关系。

1. 参公管理的事业单位：

   • 这类单位参照公务员法管理，其职工加班通常不直接发放加班费，而是通过补休或补助的形式来处理。依据《公务员法》，公务员在法定工作日之外加班的，应给予补休，不能补休的则按照国家规定给予补助。

2. 公益一类、公益二类事业单位：

   • 对于与事业单位签订劳动合同、存在劳动关系的员工（如学校后勤人员、科研机构科研辅助人员等），他们适用《劳动法》的规定。因此，在周末加班且不能安排补休的情况下，他们有权获得不低于工资200%的工资报酬作为加班费。

二、劳动合同约定与地区规定需考虑

除了单位性质和劳动关系外，劳动合同的约定以及地区规定也是影响加班工资发放的重要因素。

1. 劳动合同约定：

   • 如果劳动合同中有特别约定加班费的计算方式、是否支付等，那么应按照合同约定来执行。这意味着，即使单位性质或劳动关系符合支付加班费的条件，但如果合同中有其他约定，也需要遵循合同。

2. 地区规定：

   • 不同地区可能有针对事业单位加班的特定规定。这些规定可能涉及加班费的计算标准、支付方式等方面。因此，在判断是否可以发放加班工资时，也需要考虑当地的具体规定。

三、单位内部规章制度与维权途径

事业单位可能制定有加班相关的内部规章制度，但这些制度必须符合国家法律法规的要求，不得侵犯职工的合法权益。如果事业单位的规定或做法侵犯了职工的合法权益，职工可以通过合法途径维护自身权益，包括但不限于向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。

四、总结与建议

综上所述，事业编工作人员周末加班是否可以发加班工资，取决于单位性质、劳动关系、劳动合同约定以及地区规定等多个因素。在实际操作中，我建议您：

1. 首先了解自己所在单位的性质以及与单位建立的劳动关系类型。
2. 查看劳动合同中是否有关于加班费的特别约定。
3. 咨询当地劳动监察部门或查阅相关地区规定，了解具体的加班费支付标准。
4. 如果认为自己的加班费被低估或未支付，可以先与单位沟通协商；若协商无果，再考虑通过合法途径维护自身权益。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。