结论：系统续签劳动合同但未签订纸质合同，其有效性需分情况讨论，不能一概而论。

分析：

1. 电子合同的有效性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及《中华人民共和国电子签名法》的相关规定，电子合同与纸质合同具有同等的法律效力，只要电子合同符合法律规定的要件，即具有法律效力。
   • 在系统续签劳动合同的情况下，如果双方通过电子方式（如电子邮件、在线平台等）达成了续签合同的合意，并且该电子合同能够清晰地反映双方的权利和义务，同时符合电子签名的相关要求，那么该电子合同是有效的。

2. 未签订纸质合同的影响：

   • 尽管电子合同具有法律效力，但在实际操作中，纸质合同往往被视为更正式、更易于保存和证明的文件。
   • 如果双方仅通过系统续签了劳动合同，但未签订纸质合同，且后续发生争议时，一方可能主张电子合同的真实性、完整性或双方合意存在争议，这将增加举证和证明的难度。
   • 此外，某些地区或行业可能对劳动合同的形式有特定要求，如必须采用纸质形式等。在这种情况下，未签订纸质合同可能会影响合同的法律效力。

3. 建议措施：

   • 为了避免潜在的法律风险，建议双方在系统续签劳动合同的同时，也签订纸质合同作为备份。
   • 如果确实无法签订纸质合同，应确保电子合同的合法性和有效性，包括使用可靠的电子签名、保存完整的电子合同记录等。
   • 在续签合同前，双方应明确各自的权利和义务，并在合同中详细约定，以减少后续争议的可能性。

后续行动建议：

• 如果您已经通过系统续签了劳动合同但未签订纸质合同，且担心其法律效力问题，建议您尽快与对方协商签订纸质合同或完善电子合同的相关手续。
• 如果在续签合同过程中遇到任何法律问题或争议，您可以随时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。