结论：公司规定一个月迟到超过5次当月底薪就没有，这一规定是否合法，需分情况讨论，一般情况下不合法，但若符合法定程序且内容合理，可能被认定为合法。以下为详细分析：
一、从劳动合同和规章制度的角度分析
劳动合同的约定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。劳动合同中应当明确约定劳动报酬、工作时间、休息休假等关键条款。
- 如果劳动合同中明确规定了底薪的支付条件，且该条件不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以依据劳动合同的约定来支付底薪。但通常情况下，劳动合同不会将迟到次数作为扣除底薪的直接条件。
规章制度的制定：
- 用人单位有权制定内部规章制度，以规范员工的行为和管理。然而，这些规章制度必须符合法律法规的规定，且经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论、协商确定），并向劳动者公示或告知。
- 如果公司规章制度中明确规定了迟到超过一定次数将扣除底薪，且该规定符合法定程序、内容合理且不违反法律法规的强制性规定，那么该规定可能被视为合法有效。但“合理”的界定通常较为严格，需要综合考虑迟到对工作的影响、扣除底薪的比例等因素。
二、从法律原则和公平性的角度分析
法律原则：
- 劳动法的基本原则包括保护劳动者的合法权益、调整劳动关系、建立和维护适应社会主义市场经济的劳动制度等。任何用人单位的规章制度或劳动合同条款都不得违反这些基本原则。
- 扣除底薪作为一种处罚措施，应当与劳动者的过错程度相适应，且不得侵犯劳动者的基本生活权益。如果迟到次数与扣除底薪的比例严重失衡，或者扣除底薪导致劳动者生活陷入困境，那么该规定可能被视为不合法。
公平性：
- 公平性是劳动法中的重要原则之一。用人单位在制定规章制度或签订劳动合同时，应当遵循公平、公正的原则，确保劳动者的权益得到充分保障。
- 如果公司规定一个月迟到超过5次当月底薪就没有，这一规定可能对劳动者过于苛刻，尤其是当迟到并非出于故意或重大过失时。因此，从公平性的角度来看，该规定可能存在不合理之处。
三、建议与风险提示
对于劳动者：
- 如果认为公司的规定不合法或不合理，可以与公司进行协商，要求修改或废除该规定。
- 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对于用人单位：
- 在制定规章制度时，应当遵循法律法规的规定和劳动法的基本原则，确保规章制度的合法性和合理性。
- 如果需要扣除劳动者的工资或底薪作为处罚措施，应当确保扣除的比例与劳动者的过错程度相适应，并不得侵犯劳动者的基本生活权益。
- 规章制度制定后，应当向劳动者公示或告知，确保劳动者了解并遵守相关规定。
示例说明：假设某公司规定一个月迟到超过5次将扣除当月底薪的50%。如果这一规定未经民主程序制定或未向劳动者公示，或者扣除底薪的比例过高导致劳动者生活陷入困境，那么该规定可能被视为不合法。相反，如果这一规定经过民主程序制定、向劳动者公示，且扣除底薪的比例合理（如扣除当月底薪的10%或20%），那么该规定可能被视为合法有效。但具体还需根据实际情况和法律法规的规定来判断。
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