结论：股份经济合作社理事长一般不可以兼任出纳员，这主要基于内部控制和法律法规的双重考量。
从内部控制的角度分析：
- 内部控制要求企业或组织内部建立有效的制衡机制，以防止错误和舞弊的发生。理事长作为股份经济合作社的决策和管理层核心成员，负责整体运营和战略规划。而出纳员则负责具体的资金收付和账务记录，是财务流程中的关键执行岗位。
- 如果理事长兼任出纳员，将导致决策、执行和监督职能的集中，破坏了内部控制中的制衡原则。这种兼任可能增加资金被滥用或挪用的风险，因为缺乏独立的监督机制来制约理事长的行为。
从法律法规的角度分析：
- 根据相关法律法规和规章制度，如《中华人民共和国会计法》等，对于企业或组织的财务管理和岗位设置都有明确的规定。这些规定通常要求财务岗位之间保持独立性，以避免利益冲突和舞弊行为。
- 虽然具体法律法规可能未直接提及股份经济合作社理事长不得兼任出纳员，但根据财务管理的一般原则和内部控制的要求，可以合理推断出这种兼任是不被鼓励的，甚至可能是违反规定的。特别是在一些对财务管理要求更为严格的地区或行业，可能存在更具体的禁止性规定。
实际操作中的考虑：
- 在实际操作中，股份经济合作社应遵循内部控制和法律法规的要求，合理设置财务岗位，确保各岗位之间的独立性和制衡性。如果确实存在特殊情况需要理事长兼任出纳员，应进行充分的评估和审批，并采取额外的监督措施来降低风险。
- 然而，从风险管理和合规性的角度来看，避免理事长兼任出纳员是更为稳妥和合理的做法。这有助于保护合作社的资产安全，维护成员的利益，并提升合作社的整体治理水平。
建议：股份经济合作社应明确禁止理事长兼任出纳员，并建立完善的财务管理制度和内部控制机制。如果对于具体的岗位设置或财务管理有疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。