在合同纠纷中，选择诉讼合同主体还是收款单位，需根据具体情况来判断，以下分情况讨论：
合同主体与收款单位一致的情况：
- 如果合同中明确约定的合同主体（即签订合同的一方）与实际收款单位是同一个，那么在发生合同纠纷时，直接诉讼该合同主体即可。因为合同主体既是合同的签订者，也是款项的接收者，对合同履行负有直接责任。
合同主体与收款单位不一致的情况：
- 合同有明确约定：如果合同中明确约定了款项应支付给第三方（即收款单位），且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么在这种情况下，虽然收款单位不是合同主体，但根据合同的相对性和约定，收款单位也可能成为诉讼的对象，特别是当收款单位与合同履行有直接关联时。不过，更常见的做法是将合同主体和收款单位作为共同被告，以全面解决纠纷。
- 合同无明确约定，但存在实际关联：如果合同中没有明确约定款项应支付给第三方，但实际收款单位与合同主体存在某种关联（如母子公司、关联公司等），且该关联对合同履行产生了影响，那么在诉讼时，可以考虑将合同主体和收款单位都列为被告，或者根据具体情况选择其中一个进行诉讼。这需要根据实际案情和证据来综合判断。
- 表见代理或职务行为：如果收款单位的行为构成表见代理（即相对人有理由相信行为人有代理权）或职务行为（即行为人以单位名义从事活动，且该活动在单位授权范围内或与单位业务有关），那么单位（即合同主体）可能需要承担法律责任。在这种情况下，诉讼合同主体是更合适的选择。
法律建议：
- 审查合同条款：在发生合同纠纷时，首先应仔细审查合同条款，特别是关于合同主体、付款方式、收款单位等关键条款，以确定各方的权利和义务。
- 收集证据：收集与合同履行相关的所有证据，包括合同文本、付款凭证、通信记录等，以证明自己的主张。
- 咨询专业律师：由于合同纠纷可能涉及复杂的法律问题和事实认定，建议在诉讼前咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和诉讼策略。
可能面临的法律后果：
- 如果选择错误的诉讼对象，可能会导致诉讼程序延长、成本增加，甚至可能因诉讼对象不适格而被法院驳回起诉。
- 如果遗漏了必要的诉讼对象，可能会导致无法全面解决纠纷，需要另行起诉或面临执行困难等问题。
总结与进一步思考：
在合同纠纷中，选择诉讼合同主体还是收款单位需根据合同条款、实际履行情况、各方关联关系以及法律规定等多方面因素综合判断。为了降低诉讼风险和提高诉讼效率，建议在诉讼前充分审查合同、收集证据，并咨询专业律师的意见。如果你有具体的合同纠纷问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。