违法所得的计算通常是不包括除去合法工资部分的。以下是对这一问题的详细分析：
一、违法所得的定义与计算原则
违法所得，一般指的是通过违法行为所获得的利益或收入。在计算违法所得时，核心原则是区分合法收入与非法收入，仅将非法收入部分纳入违法所得的范畴。工资，作为劳动者通过合法劳动获得的报酬，属于合法收入，因此在计算违法所得时，通常不会被扣除或视为违法所得的一部分。
二、不同情境下的违法所得计算
劳动纠纷中的违法所得：
- 在劳动纠纷中，如果用人单位存在违法行为，如未按时支付工资、未支付加班费等，劳动者在主张权益时，可能会涉及到违法所得的计算。但这里的“违法所得”更多是指用人单位因违法行为而应支付给劳动者的额外补偿或赔偿，如加班费、经济补偿金等，而非扣除劳动者的合法工资。
- 例如，如果用人单位未支付加班费，劳动者在主张加班费时，加班费本身并不构成用人单位的“违法所得”，而是劳动者应得的合法报酬。用人单位的违法行为在于未支付这部分报酬，因此应承担支付加班费的责任。
其他领域的违法所得：
- 在其他领域，如商业欺诈、贪污受贿等，违法所得的计算同样遵循区分合法与非法收入的原则。工资作为个人合法收入，不会被视为违法所得。
- 例如，在贪污受贿案件中，违法所得通常指的是贪污或受贿的金额，而不包括行为人的合法工资收入。
三、特殊情况下的考虑
- 虽然一般情况下工资不会被视为违法所得的一部分，但在某些特殊情况下，如劳动者利用职务之便获取非法利益（如贪污、挪用公款等），且这部分利益与工资存在某种关联或混淆时，可能需要通过审计、调查等手段来区分合法与非法收入，以确保违法所得的准确计算。但这种情况并不改变工资本身作为合法收入的性质。
四、法律建议
- 对于劳动者而言，如果遇到用人单位存在违法行为导致自身权益受损的情况，应及时收集证据并寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
- 在计算违法所得或主张权益时，应明确区分合法收入与非法收入，避免将合法工资等收入误视为违法所得的一部分。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。