若认为交管局庇护下属单位存在违法行为，一般可以起诉交管局，但具体还需根据实际情况来判断。以下从几个方面为你详细分析：
一、行政诉讼的被告确定
在行政诉讼中，被告通常是作出具体行政行为的行政机关。如果交管局作为行政机关，其下属单位（如交通执法大队等）在执行公务过程中存在违法行为，而交管局对此存在庇护行为，比如包庇、纵容下属单位的违法行为，或者对下属单位的违法行为不依法处理等，那么交管局的这些行为可能构成行政不作为或滥用职权。在此情况下，你可以将交管局作为被告提起行政诉讼。
二、起诉的条件和程序
起诉条件：
- 你需要是认为交管局的庇护行为侵犯其合法权益的公民、法人或其他组织；
- 有明确的被告，即交管局；
- 有具体的诉讼请求和事实根据，比如能够提供证据证明交管局存在庇护下属单位违法行为的事实；
- 属于人民法院受案范围和受诉人民法院管辖。
起诉程序：
- 你需要先向人民法院提交起诉状，起诉状应当记明原告和被告的基本信息、诉讼请求和所根据的事实与理由、证据和证据来源等；
- 人民法院在收到起诉状后，会进行审查，符合起诉条件的，会在七日内立案，并通知你；
- 立案后，人民法院会安排开庭审理，你需要按照人民法院的通知参加庭审，并陈述自己的诉讼请求和事实理由，提供证据支持自己的主张。
三、可能面临的法律后果
如果法院认定交管局存在庇护下属单位违法行为的事实：
- 法院可能会判决交管局撤销或变更其庇护行为，或者责令交管局对下属单位的违法行为进行依法处理；
- 如果交管局的庇护行为给你造成了损失，法院还可能会判决交管局承担赔偿责任。
如果法院认定交管局不存在庇护下属单位违法行为的事实：
- 法院会驳回你的诉讼请求；
- 你可能需要承担诉讼费用等不利后果。
四、建议
- 收集证据：在提起行政诉讼前，你需要尽可能收集能够证明交管局存在庇护下属单位违法行为的事实证据，比如书面材料、录音录像、证人证言等。
- 咨询专业律师：虽然我为你提供了一些基本的法律知识和建议，但行政诉讼涉及的法律问题可能比较复杂，建议你咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。不过，既然你已经在向我咨询，我会尽我所能为你提供帮助。
- 注意诉讼时效：根据《中华人民共和国行政诉讼法》的规定，公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。因此，你需要注意诉讼时效的问题，及时提起诉讼。
希望以上分析能够对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。