结论前置：入职时约定了只做两三个月，这并不影响劳动关系的成立。只要双方存在用工事实，即劳动者为用人单位提供了劳动，且用人单位接受了这种劳动并支付了报酬，那么双方就构成了劳动关系。
详细分析：
劳动关系的定义：
- 劳动关系是指劳动者与用人单位之间，因劳动而产生的权利义务关系。这种关系不依赖于双方事先约定的劳动期限长短，而是基于实际的用工行为。
约定短期工作与劳动关系：
- 即使入职时双方约定了只做两三个月，这仅仅是对劳动期限的一种预期或约定，并不改变劳动关系的本质。只要劳动者实际为用人单位提供了劳动，且用人单位接受了这种劳动并支付了相应的报酬，那么劳动关系就已经成立。
劳动关系的确认：
- 劳动关系的确认通常依据的是实际的用工事实，而不是双方事先的约定。例如，劳动者是否为用人单位提供了劳动、用人单位是否支付了报酬、双方是否签订了劳动合同（即使合同期限很短）等，都是确认劳动关系的重要依据。
短期工作的法律后果：
- 如果双方约定了短期工作，但劳动者实际工作的时间超过了约定，或者用人单位继续接受了劳动者的劳动并支付了报酬，那么这通常被视为双方对原约定的变更，劳动关系继续存在。
- 另外，即使劳动者只工作了约定的短期时间，如果用人单位存在未支付劳动报酬、未提供劳动条件等违法行为，劳动者仍然有权依法维护自己的权益。
建议：
- 对于劳动者来说，无论入职时约定了多长的劳动期限，都应该保留好与用人单位之间的用工证据，如劳动合同、工资条、工作证等，以便在需要时证明劳动关系的存在。
- 如果劳动者在短期工作期间遇到了劳动权益受损的情况，如未支付劳动报酬、未缴纳社会保险等，应该及时向用人单位提出异议，并寻求法律帮助。
总结：入职时约定了只做两三个月，并不影响劳动关系的成立。劳动关系的确认主要依据的是实际的用工事实。因此，无论劳动期限长短，只要双方存在用工事实，就构成了劳动关系。如果你在短期工作期间遇到了任何劳动权益受损的情况，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。