结论是：工厂营业执照取消了，在一定条件下仍然可以申请仲裁。以下从不同角度为你详细分析：

仲裁申请的主体资格与工厂营业执照取消的关系

工厂营业执照取消，意味着该工厂作为市场主体在法律上的“身份”发生了变化，但这并不必然导致其丧失作为劳动仲裁中用人单位的主体资格。如果工厂只是营业执照被取消，但尚未进行清算、注销等终止程序，其民事主体资格依然存在，那么劳动者仍然可以将其作为被申请人申请劳动仲裁。例如，工厂因为违规经营被吊销营业执照，但工厂的财产、人员等尚未进行清理，此时劳动者与工厂之间存在的劳动争议，依然可以通过仲裁来解决。

仲裁申请的时间限制

即使工厂营业执照已经取消，劳动者申请仲裁也需要注意时间限制。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。所以，如果工厂营业执照取消后，劳动者发现自己的权益受到侵害，应当在法定的时效期间内申请仲裁，否则可能会面临仲裁委员会不予受理的风险。

仲裁申请的后续处理

1. 如果工厂有财产可供执行：当仲裁裁决生效后，劳动者可以向法院申请强制执行。法院会依法对工厂的财产进行查封、扣押、冻结等措施，以保障劳动者的合法权益得到实现。比如，工厂虽然营业执照被取消，但还有一些设备、存货等财产，法院可以通过拍卖等方式将财产变现，用于支付劳动者的工资、经济补偿等。
2. 如果工厂无财产可供执行：在这种情况下，劳动者的权益实现可能会面临困难。不过，如果工厂的股东存在未履行出资义务、抽逃出资等情形，劳动者可以依据相关法律规定，申请追加股东为被执行人，要求股东在未出资或抽逃出资的范围内承担责任。

实际操作建议

1. 收集证据：劳动者在申请仲裁前，要尽可能收集与劳动争议相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录、工作证等，以证明自己与工厂之间存在劳动关系以及工厂侵害自己权益的事实。
2. 确定被申请人：如果工厂营业执照取消，要了解工厂目前的法律状态，确定合适的被申请人。如果工厂已经进入清算程序，可以将清算组作为被申请人；如果工厂尚未清算，仍以工厂为被申请人。
3. 及时申请仲裁：在发现权益受到侵害后，要尽快向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，避免超过仲裁时效。

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