关于“三班两倒12小时工作制是否允许调休”的问题，结论需分情况讨论，具体如下：

1. 若企业依法安排调休，则允许
   根据《劳动法》第三十六条、第三十八条，劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周不超过44小时，且用人单位应保证劳动者每周至少休息1日。若企业采用“三班两倒12小时制”，需通过综合计算工时制或不定时工时制的审批（依据《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》），并在周期内（如月、季）安排调休，使劳动者平均工作时间符合法定标准，则调休是合法的。
   例如：某企业申请综合计算工时制后，在一个月内安排劳动者工作240小时（12小时×20天），但通过调休或支付加班费的方式，确保劳动者平均每周工作时间不超过44小时，且每月至少休息4天，则符合法律规定。

2. 若企业未依法安排调休，则可能违法
   若企业未申请特殊工时制审批，或虽申请但未在周期内安排调休，导致劳动者实际工作时间超过法定标准（如每月工作超过176小时），则属于违法行为。此时劳动者有权要求企业支付加班费（依据《劳动法》第四十四条，延长工作时间支付不低于150%工资，休息日工作且未调休支付200%工资），或向劳动监察部门投诉。
   例如：某企业未申请综合计算工时制，却强制劳动者每月工作240小时（12小时×20天），且未安排调休或支付加班费，则劳动者可主张企业支付超时加班工资（240-176=64小时，按150%计算）。

3. 调休的具体操作需符合程序要求
   即使企业依法获得特殊工时制审批，调休也需遵循以下程序：

   • 协商一致：调休应与劳动者协商，不得单方面强制安排（依据《劳动合同法》第三十五条）；
     
   • 书面记录：调休安排需以书面形式记录，避免纠纷；
     
   • 补偿优先：若劳动者不同意调休，企业应支付加班费，而非强制调休。

建议：若您所在企业采用“三班两倒12小时制”，可要求企业出示特殊工时制审批文件，并核对调休安排是否符合法定周期（如月、季）及平均工作时间要求。若发现违法情形，可收集考勤记录、工资条等证据，通过劳动仲裁或诉讼维护权益。如有具体案例或细节需要分析，欢迎进一步向我咨询。