企业将三班倒换成两班倒12小时的工作模式，在未经特殊审批的情况下，通常是不合法的。以下从不同角度为您详细分析：

工时规定角度

《中华人民共和国劳动法》明确规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。三班两倒12小时的工作模式，显然超出了每日8小时的标准工作时间。不过，如果用人单位因生产特点或工作性质不能实行标准工时制度，可以向劳动行政部门申请实行综合计算工时工作制。在获得审批后，用人单位可以按照综合计算周期（如周、月、季、年）来计算工时，只要总实际工作时间不超过总法定标准工作时间，即视为合法。但若未经审批，直接实行两班倒12小时的工作模式，则违反了劳动法的规定。

加班及报酬角度

如果两班倒12小时的工作模式未经过综合计算工时工作制的审批，或者即使经过审批但实际工作时间超过了法定标准，那么超出部分就属于加班情形。根据劳动法的规定，用人单位应当按照以下标准支付劳动者加班工资：

• 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的150%的工资报酬；
• 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的200%的工资报酬；
• 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的300%的工资报酬。

若企业未按照上述标准支付加班工资，则侵犯了劳动者的合法权益，劳动者有权要求企业补发加班工资，并可能通过法律途径维护自己的权益。

劳动者权益保护角度

除了工时和加班报酬外，用人单位还需确保劳动者的其他合法权益得到保障。这包括但不限于：

• 保证劳动者有足够的休息时间和用餐时间：长时间连续工作会对劳动者的身体健康造成损害，企业应合理安排工作时间和休息时间，避免劳动者连续高强度工作。
• 提供符合国家规定的劳动安全卫生条件和必要的劳动防护用品：企业应确保工作场所的安全卫生，为劳动者提供必要的劳动防护用品，以减少工伤事故的发生。
• 与工会和劳动者协商后方可延长工作时间：企业若需延长工作时间，应与工会和劳动者进行协商，并遵守每日和每月的延长工作时间限制。

若企业未履行上述义务，则可能面临劳动行政部门的处罚，并需承担相应的法律责任。

建议与总结

对于企业而言，若希望采用两班倒12小时的工作模式，应首先向劳动行政部门申请综合计算工时工作制，并确保在实际操作中严格遵守相关法律法规，包括工时计算、加班报酬支付以及劳动者权益保护等方面。

对于劳动者而言，应了解自己的合法权益，并在权益受到侵害时及时通过法律途径维护自己的利益。若发现企业存在违法用工行为，可以向劳动行政部门投诉或寻求法律援助。

总之，企业将三班倒换成两班倒12小时的工作模式，在未经特殊审批的情况下是不合法的。企业应遵守劳动法律法规，保障劳动者的合法权益；劳动者也应增强法律意识，维护自己的合法权益。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。