单位实行“上12小时休24小时”的工作制度是否合法，需结合具体情况及国家相关法律法规进行综合判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、符合法律规定的情形
特殊工时制度审批：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十九条，企业因生产特点不能实行标准工时制度的（即每日不超过8小时，每周不超过44小时），经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，包括综合计算工时工作制或不定时工作制。
- 若单位已获得劳动行政部门的特殊工时制度审批，并明确实行“上12小时休24小时”的工作制度，且该制度确保了劳动者平均工作时间和休息休假等权益不受侵害，则为合法。
平均工作时间合规：
- 在特殊工时制度下，单位需确保劳动者在一个计算周期内（如一周）的平均工作时间不超过法定上限。以“上12小时休24小时”为例，若此模式循环执行，且劳动者在一周内的平均工作时间未超过44小时，则符合法律规定。
休息休假保障：
- 用人单位还需保证劳动者每周至少休息一日，以及享受国家规定的带薪年休假等休息休假权利。若“上12小时休24小时”的安排未影响劳动者的这些权益，则不违反法律规定。
二、不符合法律规定的情形
未经审批擅自实施：
- 若单位未获得劳动行政部门的特殊工时制度审批，擅自实行“上12小时休24小时”工作制度，即使平均工作时间未超标，也构成违法。因为特殊工时制度的实施需经过法定程序审批。
超时工作与加班违规：
- 在特殊工时制度下，若劳动者实际工作时间超过法定上限，或单位未依法安排补休、支付加班工资，则违法。例如，若“上12小时休24小时”的安排导致劳动者在法定节假日或休息日工作，且未获得相应的加班工资或补休，则违反法律规定。
休息日与带薪年休假缺失：
- 若“上12小时休24小时”的安排导致劳动者连续工作时间过长，无法保障每周至少休息一天或享受带薪年休假，也违反法律规定。因为劳动者有权享受法定的休息休假权利。
三、法律建议与风险提示
- 对于单位：在实行“上12小时休24小时”工作制度前，应首先明确本单位的工时制度类型，并依法向劳动行政部门申请审批。同时，需严格遵循法律法规关于工作时间、休息休假等方面的规定，确保劳动者的合法权益不受侵害。
- 对于劳动者：如遇单位违法安排工作时间，应及时向劳动监察部门投诉举报，维护自身合法权益。同时，劳动者也有权了解自己的工作时间和休息休假权利，并在必要时寻求法律援助。
总结来看，单位实行“上12小时休24小时”工作制度是否合法，取决于是否经过劳动行政部门审批、是否确保劳动者平均工作时间和休息休假等权益不受侵害。若单位未依法执行相关规定，则该工作模式可能构成违法。因此，建议单位在实行此类工作制度前，务必咨询专业法律人士或劳动行政部门，确保合规性。如有任何法律疑问，也可以直接向我咨询。