公司将挂靠车辆抵押是否合法，需分情况讨论：
若公司对挂靠车辆享有合法所有权或处分权：
- 在这种情况下，公司作为车辆的所有权人或依法享有处分权的人，有权对车辆进行抵押。抵押行为需符合《中华人民共和国民法典》中关于抵押的相关规定，如签订书面抵押合同、办理抵押登记（如需）等。只要抵押行为合法合规，且不存在其他无效情形（如欺诈、胁迫等），该抵押行为就是合法的。
若公司对挂靠车辆不享有合法所有权或处分权：
- 如果公司未经挂靠车主同意，擅自将挂靠车辆进行抵押，这可能构成无权处分。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无权处分人以自己的名义处分他人财产的，经权利人追认或者无处分权的人订立合同后取得处分权的，该合同有效；否则，合同效力待定，且可能因侵害他人财产权而面临法律责任。
- 此外，如果公司明知自己对车辆不享有合法权利，仍进行抵押，还可能构成欺诈等违法行为，需承担相应的法律责任。
法律建议：
- 对于公司而言：在决定将挂靠车辆进行抵押前，应确保自己对车辆享有合法所有权或处分权，并了解抵押的相关法律规定和程序。必要时，可咨询专业律师以获取法律意见。
- 对于挂靠车主而言：应定期关注自己的车辆状况，确保公司未擅自将车辆进行抵押或其他处分行为。如发现公司存在违法行为，应及时采取法律措施维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果公司合法抵押挂靠车辆，且抵押行为符合法律规定，那么该抵押行为将产生法律效力，公司有权在抵押范围内优先受偿。
- 如果公司非法抵押挂靠车辆，可能面临合同无效、赔偿损失等法律责任。同时，挂靠车主也有权要求公司停止侵害、恢复原状或赔偿损失等。
总结：公司将挂靠车辆抵押是否合法，关键在于公司是否对车辆享有合法所有权或处分权。在涉及此类问题时，建议双方均咨询专业律师以获取准确的法律意见和保障自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。