针对您提出的“工厂自离不让出厂门是否违法”的问题，这确实是一个涉及劳动权益和工厂管理规定的复杂议题。以下是我为您提供的详细分析：

首先，我们需要明确“自离”或“自动离职”的法律含义。在《劳动合同法》实施之前，“自动离职”可能被视为员工单方违法解除劳动合同的行为。但在《劳动合同法》实施后，这一概念已不再适用。现在，当员工出现类似“自动离职”、“不辞而别”等情形时，用人单位不能直接认定双方劳动关系已经解除，而应当通过合法程序，如要求员工办理辞职手续、送达催告复工通知书等，来处理员工的离职问题。如果联系不上员工，用人单位应当及时按照严重违反规章制度等理由与员工解除劳动关系，以避免劳动关系一直存续。

接下来，我们针对您提出的具体问题进行分析：

1. 工厂是否有权阻止自离员工出厂门？

   • 工厂作为用人单位，其管理行为应当遵循法律法规和劳动合同的约定。在员工未按照合法程序办理离职手续的情况下，工厂不能简单地通过阻止员工出厂门的方式来处理。这种行为可能侵犯员工的人身自由权，从而构成违法。

2. 工厂应如何合法处理自离员工？

   • 工厂应当首先尝试与员工取得联系，了解其离职原因和意愿，并要求其按照合法程序办理离职手续。
   • 如果员工拒绝配合或无法联系，工厂应当依据内部规章制度，按照严重违反规章制度等理由与员工解除劳动关系，并办理相关手续。
   • 在处理过程中，工厂应当确保所有行为都符合法律法规和劳动合同的约定，避免侵犯员工的合法权益。

3. 员工自离可能带来的法律后果：

   • 如果员工自离被认定属于违法解除劳动合同，且给工厂造成损失的，工厂有权要求员工承担赔偿责任。
   • 同时，如果员工在离职过程中违反了保密义务、竞业限制或签订了专项培训协议并约定了服务期，工厂还可能享有违约金求偿权。

综上所述，工厂在处理自离员工时，应当遵循法律法规和劳动合同的约定，通过合法程序来处理员工的离职问题。阻止自离员工出厂门的行为可能构成违法，工厂应当避免采取此类措施。如果员工自离给工厂造成损失或违反了相关约定，工厂可以通过合法途径来维护自己的权益。