分公司被撤销，一般情况下可以终止与员工的劳动关系，但需依法进行并履行相应义务。以下从不同角度详细分析：
一、分公司被撤销的法律后果
分公司作为总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。当分公司被撤销时，其民事主体资格消灭，这意味着分公司无法再以自己的名义从事民事活动，包括与员工签订或履行劳动合同。因此，从法律层面讲，分公司被撤销后，其与员工的劳动关系在客观上无法继续维持，可以视为劳动关系终止的一种法定情形。
二、终止劳动关系的合法程序
尽管分公司被撤销可能导致劳动关系终止，但这一过程必须依法进行，不能随意解除或终止劳动合同。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在解除或终止劳动合同时，应当遵循法定程序，包括提前通知员工、支付经济补偿金（如适用）、办理离职手续等。具体来说：
提前通知：用人单位应当提前三十日以书面形式通知员工本人，或者额外支付员工一个月工资后，可以解除劳动合同（在符合特定情形下，如员工患病或非因工负伤、不能胜任工作等）。然而，在分公司被撤销的情况下，这一通知义务可能因情况紧急而有所调整，但用人单位仍应尽最大努力通知员工。
支付经济补偿金：如果分公司被撤销导致劳动合同解除，且符合《劳动合同法》规定的支付经济补偿金的情形（如用人单位提出解除劳动合同并与员工协商一致、用人单位依照企业破产法规定进行重整等），则用人单位应当向员工支付经济补偿金。经济补偿金的计算标准通常按照员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。
办理离职手续：用人单位在终止劳动关系时，应当为员工办理离职手续，包括出具解除或者终止劳动合同的证明、办理档案和社会保险关系转移手续等。
三、特殊情况下的处理
员工不同意终止：如果员工对分公司被撤销导致的劳动关系终止有异议，可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求确认劳动关系是否终止、要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金等。
总公司承接劳动关系：在分公司被撤销后，如果总公司愿意承接分公司的员工和业务，那么员工与分公司的劳动关系可以自然转变为与总公司的劳动关系。这种情况下，劳动关系并未真正终止，而是发生了主体变更。
四、法律建议
对于用人单位：在分公司被撤销前，应提前规划好员工的安置方案，包括与员工协商解除劳动合同、支付经济补偿金、办理离职手续等。同时，应确保整个过程符合法律法规的规定，避免引发劳动争议。
对于员工：如果得知分公司将被撤销，应主动与用人单位沟通了解自己的权益和安置方案。如果对用人单位的处理方式有异议，可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼来维护自己的合法权益。
在实际操作中，每个案例的具体情况可能有所不同。如果你面临分公司被撤销导致劳动关系终止的问题，或者有任何其他劳动法律方面的疑问，可以直接向我咨询。