总包多次将工程款转入私人指定账户，这一行为是否违法，需结合具体情况来判断，但通常情况下，这种行为存在较大的违法风险。以下从几个角度进行详细分析：

1. 违反财务规定与合同约定：

   • 在正常的工程承包关系中，工程款的支付应当遵循严格的财务制度和合同约定。总包单位通常应将工程款支付至分包单位或供应商的官方账户，以确保资金的安全和合规使用。
   • 如果总包单位未经合法程序，擅自将工程款转入私人指定账户，这很可能违反了公司的财务规定和与分包单位或供应商的合同约定，构成违约行为。

2. 涉嫌挪用资金或职务侵占：

   • 如果总包单位的负责人或相关人员利用职务之便，将工程款转入私人账户，并用于个人消费或投资等非工程相关用途，这可能涉嫌挪用资金罪或职务侵占罪。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，挪用资金罪和职务侵占罪都是严重的犯罪行为，一旦查实，将面临法律的严惩。

3. 税务风险：

   • 将工程款转入私人账户还可能引发税务风险。因为私人账户的收入往往难以纳入公司的税务申报体系，可能导致公司漏税或逃税。
   • 税务机关在发现此类行为后，有权对公司进行税务稽查，并要求补缴税款、滞纳金及罚款等。

4. 法律建议与风险防范：

   • 对于总包单位而言，应严格遵守财务制度和合同约定，确保工程款的支付合规、透明。
   • 如果确实需要向个人支付款项（如劳务费等），应确保有合法的合同依据和税务申报手续，避免引发不必要的法律风险。
   • 对于分包单位或供应商而言，应密切关注工程款的支付情况，一旦发现异常应及时与总包单位沟通并寻求法律帮助。

可能面临的法律后果：

• 如果总包单位的行为被认定为违法或犯罪，将可能面临行政处罚（如罚款、吊销营业执照等）或刑事处罚（如有期徒刑、罚金等）。
• 同时，总包单位还可能因违约行为而承担民事赔偿责任，如赔偿分包单位或供应商因此遭受的损失。

总结与提醒：

• 总包多次将工程款转入私人指定账户的行为存在较大的违法风险，可能涉及财务违规、合同违约、挪用资金或职务侵占以及税务风险等多个方面。
• 因此，建议总包单位严格遵守相关法律法规和合同约定，确保工程款的支付合规、透明。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。