结论前置：
- 若不存在时效中断或中止的法定情形，且已超过仲裁时效，法院一般不会支持公司在一审时提出的时效抗辩，即劳动者要求支付二倍工资的诉求可能得到支持的情况将不复存在，法院会倾向于驳回该诉求。
- 若存在时效中断、中止或其他特殊情况，法院仍有可能根据具体情况对二倍工资赔偿请求进行实质性审查，并有可能支持公司的时效抗辩，也可能不支持，这取决于具体证据和案情。
详细分析：
在劳动仲裁及后续的诉讼过程中，仲裁时效是一个至关重要的法律概念。它规定了当事人向劳动争议仲裁机构或法院请求保护其权利的法定期限。对于二倍工资的诉求，同样受到仲裁时效的限制。
仲裁时效的基本规定：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这意味着，如果劳动者在知道或应当知道其权利被侵害后超过一年才提起仲裁或诉讼，那么其诉求可能会因超过时效而被驳回。
公司未在仲裁时提出时效抗辩，一审时提出的情况：
- 如果公司在仲裁阶段没有提出时效抗辩，而在一审阶段才提出，这并不意味着法院一定会支持公司的抗辩。法院在审理时，会综合考虑多种因素，包括是否存在时效中断、中止的法定情形，以及劳动者是否因特殊原因无法及时主张权利等。
- 若不存在时效中断或中止的情形：一旦确认超过仲裁时效，且没有特殊情况导致时效延长或中断，法院通常会遵循仲裁时效的规定，认为劳动者已丧失了通过法律途径主张二倍工资的权利，因此会支持公司的时效抗辩，驳回劳动者的诉求。
- 若存在时效中断或中止的情形：如果劳动者能够提供证据证明存在时效中断（如向用人单位主张过权利、向有关部门请求权利救济等）或中止（如因不可抗力或其他正当理由导致无法主张权利）的情形，那么即使表面上看超过了仲裁时效，法院仍有可能对二倍工资赔偿请求进行实质性审查，并根据具体情况作出判决。在这种情况下，法院可能不支持公司的时效抗辩，而是根据实际证据和案情来判定是否支持劳动者的诉求。
特殊情况下的处理：
- 除了时效中断和中止外，还有一些其他特殊情况可能影响法院对时效抗辩的判断。例如，如果劳动者与用人单位在仲裁或诉讼过程中达成了和解协议，或者用人单位自愿支付了二倍工资等，这些情况都可能对法院的判决产生影响。
建议与提醒：
- 对于劳动者而言，应及时了解自己的权利状况，并在知道或应当知道权利被侵害后尽快通过法律途径主张权利，以避免错过仲裁时效。
- 如果确实存在特殊情况导致无法及时主张权利，劳动者应尽可能收集相关证据，以证明时效中断、中止等事由，为争取自身权益提供有力支持。
- 对于公司而言，虽然可以在一审时提出时效抗辩，但应谨慎行使这一权利，并充分考虑可能面临的法律后果和声誉风险。
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