保密费是否计入工资总额，需分情况讨论：

1. 若保密费属于工资性质的组成部分：

   • 根据《关于工资总额组成的规定》第四条，工资总额由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资六个部分组成。若保密费是作为对员工因承担保密义务而给予的补偿，且该补偿与员工的劳动付出直接相关，那么保密费应当计入工资总额。例如，某些企业会按月支付员工保密费，作为对其保守商业秘密的报酬，这种情况下，保密费就属于工资的一部分。

2. 若保密费属于非工资性质的补偿或赔偿：

   • 如果保密费是作为对员工离职后遵守保密协议的额外补偿，或者是对员工因保密义务而可能遭受的损失（如就业机会受限）的赔偿，且该费用并非与员工的日常劳动付出直接相关，那么保密费可能不被计入工资总额。例如，员工离职时，企业一次性支付一笔保密费，要求员工在离职后一定期限内不得泄露企业商业秘密，这种情况下，保密费更类似于一种违约金或赔偿金，而非工资。

法律建议：

• 对于企业而言，在制定保密协议和支付保密费时，应明确保密费的性质和目的，并在协议中明确约定保密费是否计入工资总额。这有助于避免未来可能出现的劳动纠纷。
• 对于员工而言，在签订保密协议时，应仔细阅读协议条款，了解保密费的性质和支付方式。如果对保密费是否计入工资总额有疑问，可以向企业的人力资源部门或法律顾问咨询。

可能后果：

• 如果保密费被错误地计入或未计入工资总额，可能会影响员工的社保缴纳基数、经济补偿金计算等。例如，如果保密费实际上属于工资的一部分，但企业未将其计入工资总额，那么在计算经济补偿金时，可能会因基数不准确而导致员工权益受损。

总结：保密费是否计入工资总额，取决于其性质和目的。企业在支付保密费时，应明确其性质，并在协议中明确约定；员工在签订保密协议时，也应仔细了解相关条款，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。