结论：保密薪资是否算到工资里面，需根据用人单位与劳动者的具体约定及实际情况来判断。若双方有明确且合法的约定，保密薪资可单独支付或包含在工资中；若无明确约定或约定不合法，则可能面临法律风险。
详细分析：
法律未强制支付保密薪资：
- 根据《劳动合同法》等相关法律法规，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守商业秘密和与知识产权相关的保密事项。但法律并未明确规定用人单位必须向劳动者支付保密薪资，即支付保密薪资并非用人单位的法定义务。
保密薪资包含在工资中的合法性：
- 若用人单位与劳动者在劳动合同或保密协议中明确约定将保密薪资包含在工资中，并且该约定合理、合法，同时工资总额能够体现包含保密薪资的构成，且用人单位已向劳动者明确告知，则此做法合法有效。例如，劳动合同中清晰写明员工工资由基本工资、岗位工资和保密薪资组成，并在工资条上明确列示各项明细，员工签字确认且未提出异议，此时保密薪资算在工资中是合法的。
未明确约定或未告知的风险：
- 若用人单位未与劳动者在合同中明确约定保密薪资的相关事宜，或虽约定但未明确告知工资中包含保密薪资，只是单方面将保密薪资混入工资发放，这可能侵犯了劳动者的知情权。在此情况下，一旦发生劳动争议，劳动者可能不认可工资中包含保密薪资，用人单位也难以证明已就保密薪资事项与劳动者达成一致意见，从而可能面临不利的法律后果。
保密薪资的单独支付：
- 如果用人单位与劳动者有明确的约定，保密薪资是单独支付的，并且该费用合理、合法，那么保密薪资就不应包含在工资中。单独支付的保密薪资应确保有明确的支付依据和合理的支付标准，以避免可能的法律纠纷。
法律建议：
- 明确约定：为确保双方的权益，建议在劳动合同或保密协议中明确约定保密薪资的相关事宜，包括支付方式、支付标准、支付时间等，并确保该约定符合相关法律法规的规定。
- 履行告知义务：用人单位应履行告知义务，确保劳动者知晓自己工资的具体构成和各项费用的发放依据，避免侵犯劳动者的知情权。
- 保留证据：无论是将保密薪资包含在工资中还是单独支付，用人单位都应保留好相关证据，如工资条、保密协议、支付记录等，以备不时之需。
可能后果：
- 若用人单位未与劳动者明确约定保密薪资的支付方式，或未履行告知义务，一旦发生劳动争议，用人单位可能面临败诉的风险，需要承担相应的法律责任。
- 若用人单位以保密薪资为借口，实施不合理的薪酬歧视或掩盖违法行为，如克扣、拖欠工资等，将可能违反劳动法的相关规定，面临更严重的法律后果。
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