关于员工工资中保密费的计算方式，这主要取决于用人单位与劳动者之间的具体约定以及实际情况。以下是对保密费计算方式的详细解答：
一、保密费是否包含在工资中
根据约定判断：
- 若用人单位与劳动者在劳动合同或保密协议中有明确且合法的约定，保密费可以单独支付，也可以包含在工资中。
- 若无明确约定或约定不合法，则用人单位可能面临法律风险。
合法性要求：
- 若保密费包含在工资中，劳动合同或保密协议应明确约定，并且工资总额应能体现包含保密费的构成。
- 用人单位需向劳动者明确告知工资中包含保密费，并确保劳动者知晓且未提出异议。
二、保密费的计算标准
无固定标准：
- 国家并未对保密费的具体数额或比例作出明确规定。
- 保密费的计算通常根据用人单位的商业秘密的重要性、劳动者的职位、责任以及市场行情等因素由用人单位自行决定。
常见做法：
- 在一些企业中，保密费可能会作为工资的一部分，按照一定比例（如月工资的15%或更高）进行发放。
- 但这并非强制要求，具体比例应由用人单位与劳动者协商确定。
三、保密费的支付方式
单独支付或包含在工资中：
- 如前所述，保密费可以单独支付，也可以包含在工资中一起发放。
- 若包含在工资中，应在工资条上明确列示保密费的金额。
支付时间：
- 保密费通常按月发放，但具体支付时间应由用人单位与劳动者在劳动合同或保密协议中约定。
四、注意事项
确保约定合法：
- 用人单位在与劳动者约定保密费时，应确保约定内容合法、合理，不违反相关法律法规的规定。
履行告知义务：
- 用人单位应履行告知义务，确保劳动者知晓自己工资的具体构成和各项费用的发放依据，包括保密费。
避免法律风险：
- 若用人单位未与劳动者明确约定保密费或未履行告知义务，可能面临劳动者不认可工资中包含保密费、要求补发或提起劳动争议等法律风险。
综上所述，员工工资中保密费的计算方式主要由用人单位与劳动者之间的具体约定决定。为确保双方的权益，建议在劳动合同或保密协议中明确约定保密费的相关事宜，包括支付方式、支付标准、支付时间等，并确保该约定符合相关法律法规的规定。同时，用人单位应履行告知义务，确保劳动者知晓自己工资的具体构成和各项费用的发放依据。