结论：公司合并后，退休保护期员工不愿意去新公司是否有赔偿，主要取决于劳动合同的变更情况、员工离职的具体原因以及双方的协商结果。以下从不同角度为您详细分析：
一、劳动合同继续有效原则
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条的规定，用人单位发生合并或分立等情况时，原劳动合同继续有效，并由承继其权利和义务的用人单位继续履行。这意味着，如果新公司没有提出变更劳动合同的要求，员工应继续按照原合同的约定在新公司工作。在此情况下，如果员工无正当理由拒绝去新公司，并主动提出离职，那么用人单位通常无需支付经济补偿。
二、劳动合同变更与赔偿
变更主要内容：如果新公司要求变更劳动合同的主要内容，如工作地点、工作岗位、薪资待遇等，并且员工不同意这些变更，导致劳动合同无法继续履行，那么用人单位应当支付经济补偿。经济补偿的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
未变更但条件变差：即使新公司未明确提出变更劳动合同，但如果实际工作条件相较于原公司明显变差，且这种变化足以影响员工的权益，员工因此不愿意去新公司并导致劳动合同解除的，用人单位同样可能需要支付经济补偿。
三、员工主动离职的情况
个人原因离职：如果新公司维持或提高了劳动合同约定的条件，员工却因个人原因（如个人喜好、家庭因素等）不愿意去新公司，并主动提出离职，那么用人单位通常无需支付经济补偿。
法定离职原因：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条的规定，用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同，并有权获得经济补偿：
若员工是因为上述法定离职原因而离职，即使是在公司合并的背景下，用人单位依然需要支付经济补偿。
四、特殊情况考虑
新公司提供更优条件但员工仍拒绝：如果新公司为员工提供了与原公司相当甚至更好的工作条件和待遇，而员工无正当理由拒绝前往新公司工作，这种情况下可能被视为员工主动放弃工作机会，公司有可能不支付经济补偿。不过，公司需要提供充分的证据证明新公司的条件确实更优以及员工拒绝的合理性。
劳动合同中有特殊约定：如果在签订劳动合同时，双方对于公司合并后员工的工作安排和经济补偿有特殊的约定，那么就应当按照合同约定来执行。例如，合同中明确规定了在公司合并的情况下，员工必须服从到新公司工作的安排，否则视为自动离职且没有经济补偿，那么员工就需要遵守这一约定。
五、建议与行动
与公司协商：在面对公司合并导致的劳动合同变更或解除问题时，员工应首先尝试与公司进行协商，以寻求双方都能接受的解决方案。
了解自身权益：员工应详细了解自己的权益和义务，包括劳动合同的具体内容、经济补偿的计算方式等。
寻求法律帮助：如果协商无果，或者员工对自身的权益有疑问，可以直接向我咨询，以便更好地了解自己的权益和可能的法律途径。
综上所述，公司合并后员工不愿意去新公司是否有赔偿，取决于多个因素。在处理此类问题时，建议员工保持冷静，详细了解自己的权益和义务，并积极与公司进行沟通协商。如有需要，也可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。